用于qiime的默认引用数据文件。
qiime-default-reference的Python项目详细描述
qiime默认参考
qiime默认引用是一个 包含用于的默认引用数据文件的python包 QIIME。当前的默认引用数据已编译 来自greengenes 16srrna数据库版本 13_8。 有关详细信息，请参见下面的属性部分。
安装
要安装qiime默认参考：
pip install qiime-default-reference
运行测试
运行qiime默认引用的单元测试：
nosetests --with-doctest qiime_default_reference
归因
此python包中分发的引用数据是从 Greengenes 16S rRNA database：
一种改进的绿色基因分类法，具有明确的生态和 细菌和古细菌的进化分析。 McDonald D、Price MN、Goodrich J、Nawrocki EP、Desantis TZ、Probst A， 安徒生德国劳埃德船级社，奈特R，Hugenholtz P. ISME J.2012年3月；6（3）：610-8。doi:10.1038/ismej.2011.139。
greengenes的参考数据是根据 Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License。
默认模板对齐列掩码（即“车道掩码”）来自：
Lane，D.J.（1991）16s/23srrna测序。在Stackebrandt，E.和 古德费罗，M.（编辑），细菌系统学中的核酸技术。 约翰·威利和儿子，纽约，第115-175页。
lane mask最初在ARB中可用。
从here取的通道掩码。
获得帮助
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