python usi submission rest api包含与embl-ebi统一提交接口交互的所有方法
pyUSIrest的Python项目详细描述
python usi提交rest api
python usi submission rest api包含与embl-ebi交互的所有方法 统一提交界面
- 自由软件：GNU通用公共许可v3
- 文档：https://pyusirest.readthedocs.io。
功能
- 处理ebi AAP（身份验证、授权和配置文件）服务， 生成令牌并处理用户和组
- 与ebi usi（统一提交接口）交互，以便将数据提交到
如本guide所述的生物样品。详细信息：
- 正在获取USI API root
- 选择Team
- 创建Submission
- 添加items to Submission
- 检查生物样品Validation
- Finalising提交
学分
这个包是用Cookiecutter和audreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。
历史记录
0.2.2（2019-03-28）
功能
- 处理API错误（50x，40x）
0.2.1（2019-01-15）
功能
- 测试是否有空提交（无样本）
- 更新了root.json，usersubmission.json测试数据
- 按名称进行提交时，submissionstatus不再是属性
在获取用户提交时出现
- 遵循SubmissionStatus链接（如有必要）
- 创建新提交后更新提交状态
- 在get_submission_by_name
之后更新提交状态
- 重新加载刚完成的提交后更新提交状态
- Domain.users返回列表中的User对象
- 改进的Submission.get_samples方法
0.2.0（2018-10-23）
功能
- 按名称获取提交文件
- 将库名称更改为pyUSIrest
- 发布给PYPI
- 使用put完成提交
0.1.0（2018-10-17）
功能
- 使用python方法提交到biosample中
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