pymacroms 1.0.5

pymacroms

复杂高分辨率聚合物质谱的高效定量

这个程序的目的是识别和量化大分子物种 在基于所用单体的高分辨率质谱中，可能的端基 加合离子。实验光谱作为中心峰值表导入 从逗号分隔值（CSV）文件或直接从thermo raw文件（从v1.0.0）。请查找示例用法的代码 在我们的webpage上。

从版本1.0.0开始，pymacroms需要64位版本的python。

依赖关系

pymacroms需要安装以下模块：

• IsoSpecPy用于同位素模式的生成
• 用于数据处理的numpy和pandas
• 通过线性回归进行量化的sklearn
• matplotlib用于快速表示结果
• ProgressBar2用于在更耗时的步骤中获得反馈
• 用于生成pdf报告的reportlab和svglib
• 与Thermo的RawFileReader接口的pythonnet

引文

有关算法和 在工作中使用pymacroms时请引用我们：

K. De Bruycker, T. Krappitz, C. Barner-Kowollik, ACS Macro Lett.2018, 1443-1447.

许可证

• pymacroms在麻省理工学院的许可下是免费的。 有关详细信息，请参阅许可证文件。
• pymacroms使用rawfilereader读取工具。版权所有©2016赛默飞世尔科技公司。保留所有权利。 如果使用pymacroms，则表示您同意rawfilereader的许可协议，在安装pymacroms时会提供该协议的副本。

更改日志

1.0.5

• 引入了对扫描过滤器的基本支持（将导入的数据限制为1种扫描类型）。不同的扫描类型对平均算法是有害的，而且可能没有什么意义。
• 提高与unix系统的兼容性，安装pythonnet包似乎是最大的困难。
• 小错误修复

1.0.0

• Thermo原始文件现在可以用作输入，而无需任何预处理
  • 默认情况下，所有扫描都是单独导入的
  • 扫描可以通过提供一系列扫描或保留时间来平均
• 引入了新的msdata类
  • 处理csv文件（以前是spectrum类）和thermo raw文件的读取
  • 存储所有导入的光谱和相应的处理结果，以便对多个扫描进行批处理
  • 后处理的结果仍然在频谱类，所以每次扫描的基础…未来问题
• 版本1.0.0及以后的版本是根据麻省理工学院的许可证（而不是GNU GPL v3.0的旧版本）授权的，以符合Thermo的RawFileReader的许可要求

0.2.0

• 等压物种现在已预过滤，这将显著缩短计算时间
• 引入了定义单体/端基自定义数据库的选项（优先级高于内置数据库）
• 引入了将输出保存为pdf报告的选项

0.1.2

• 更新代码以使用新的isospecpy 1.9.x api

0.1.1

• 与isospecpy接口的小修复程序
• 修复了与isospecpy 1.9.x的兼容性

0.1.0

• 初始版本

标签：

• 文件
• 程序
• 版本
• thermo
• 物种
• 高分辨率
• 定量
• 质谱
• isospecpy

欢迎加入QQ群-->： 979659372

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