Python 物种_专题 - Python中文网

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关于物种相关联的Python项目和问题：

从不同的modu导入类的实例

我有一个名为directory的模块和另一个名为species的模块。不管我有多少种，总会有一个目录。在目录模块中，我有一个目录类。在物种模块中，我有许多不同的物种类。 #module named ...

2024-04-21 已阅读: n次

仅显示图例Python Matplotlib中的某些项

我目前正在绘制一个包含大量分类数据的堆积条形图，并且只希望显示传说中的重要物种（在~500个物种中，我希望显示~25个）。有什么简单的方法可以做到这一点吗？下面是我的代码： labels=['0',' ...

2024-04-21 已阅读: n次

自动对数组中的元素进行分类

我正在建立一个给定地点的植被类型的行程。数据以CSV的形式传递给我，我需要一种方法，可以自动地将一列中的项目重新分类为我提供的更广泛的类。我已经可以用pandas读取数据，做一些整理工作，然后将数据帧 ...

2024-04-21 已阅读: n次

如何使用spaCy创建新实体并仅从关键字lis学习

我试图用spaCy创建一个新的实体分类'物种'与物种名称列表，例如他可以找到here。我在this spaCy tutorial（Github代码here）中找到了一个培训新实体类型的教程。但是，问 ...

2024-04-21 已阅读: n次

查询Ensemb

有没有可能用自由形式的搜索词以编程的方式（最好是python）查询所有的Ensembl，类似于从他们的web用户界面所做的事情？restapi似乎根本不支持搜索词查询，其他直接与MySQL数据库交互的 ...

2024-04-21 已阅读: n次

numpy.cov（）异常：“float”对象没有“shape”属性

我有一个不同植物物种的数据集，我把每个物种分成不同的np.array。当试图从这些物种中生成高斯模型时，我必须计算每个不同标签的均值和协方差矩阵。问题是：在其中一个标签中使用np.cov()时，函 ...

2024-04-21 已阅读: n次

用多个字典值替换列中的值

我正在处理鸟类分类学，需要标准化常见的名称。要标准化的文件由林地公会物种组成，由一列包含旧的通用名称组成。第二个文件是一个字典，它列出了旧的公共名称（键）和新的公共名称（值）。例如 dict = {' ...

2024-04-21 已阅读: n次

R函数%in%的等价物是什么？

R函数%in%的等价物是什么当我们在R中有一个数据帧时，我们可以使用操作符%in%检查列中包含列表中的字符串的行，该操作符提供布尔输出具体示例：如果我们想检查字符串“setosa”和“virgin ...

2024-04-21 已阅读: n次

这个反应系统能被建模为隐马尔可夫模型吗？

我想模拟一个化学反应网络，它由化学计量矩阵V (s x m)定义，其中s是参与物种的数量，而m是化学反应的数量。如果一种物质i在反应j中充当排出物，则用V_i,j < 0表示，如果i在反应j中产 ...

2024-04-21 已阅读: n次

如何在一行中显示多个字段？（Django行政）

我一直在与Django/Mysql中的一种情况作斗争在同时具有主键和外键的表中有此列。此列与中间表具有一对多关系这是一份与植物物种有关的州的名单。有些物种可以在多个州找到物种（表1）列：物种i ...

2024-04-21 已阅读: n次

当多个值为sam时删除字典键

当字典的值都相同时，我想删除它的键。简言之，我正在尝试移除任何只有一个物种的集群。我的数据如下： 11554 sulc 11554 rubr 11554 rugi 11554 tu ...

2024-04-21 已阅读: n次

CSV根据类别/nam在Python中打印

我已经设法根据某人输入的x轴和y轴的列号来绘制数据。我的数据格式为CSV，其中第五列中有一个物种名称： 5.1,3.5,1.4,0.2,Iris-setosa 7.0,3.2,4.7, ...

2024-04-21 已阅读: n次

checklists

checklists是一个可重用的django应用程序，包含一个功能齐全的模型和一个用于构建用于管理和发布的web应用程序的管理站点。它提供了以下一组功能：*一个全面的模型，用于捕获有关访问某个站点的 ...

2024-04-21 已阅读: n次

radis

RADIS 非平衡红外发射与吸收逐行编码后处理库比较实验光谱和计算光谱。用户指南、安装过程和示例可在RADIS Website：开始安装假设您安装了python Anaco ...

2024-04-21 已阅读: n次

django-triodia

triodia是一个django应用程序，用于解析分类名称并将其与公共生物多样性数据服务的数据库进行核对。Triodia目前主要的API调用依赖于全球生物多样性确认工具（GBIF），可以认为是该API ...

2024-04-21 已阅读: n次

neuromorpholib

#neuromorpholib“acc1”）`````>一个查询所有物种=小鼠神经元：````python>小鼠神经元=nmo.search（{“物种”：“鼠标”}）```````>下载一个用于小鼠神 ...

2024-04-21 已阅读: n次

scgen

scgen 简介 scgen的tensorflow实现。scgen是一个生成模型，用于预测跨细胞类型、研究和物种的单细胞扰动响应。 (Nature Methods, 2019)。开始 ...

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nauta-cli

（p）35；Nauta-cli 原文[Atijelo/Nauta-cli]（这是一个在线指令（CLI）对管理古巴被俘的门户网站（NAUTA）的一个有用的工具，它是一个在线指令。（p）的翻译是 ...

2024-04-21 已阅读: n次

phylopypruner

关于 orthologs是通过物种形成事件相关的基因，而 paralogs是通过基因复制事件相关的基因。准确鉴定直系生物是系统基因组学的先决条件，因为包括因物种基因复制事件而分化的基因树推断可 ...

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scythe

scythe，通过同源性评估选择保守的转录本，试图为来自两个或更多物种的每个一对一同源基因找到最佳匹配的转录本集。用法（gui）： scythe-gui.py 用法（命令行）： ###### ...

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pymacroms

pymacroms 复杂高分辨率聚合物质谱的高效定量这个程序的目的是识别和量化大分子物种在基于所用单体的高分辨率质谱中，可能的端基加合离子。实验光谱作为中心峰值表导入从逗号分隔值（CSV）文件 ...

2024-04-21 已阅读: n次

XenoMapper

氙气探测器 xenomapper是一个实用程序，用于对已与主基因组和次基因组对齐的映射读取进行后处理，binning读取到物种特定的、每个物种中的多重映射、未映射和未分配的存储箱。它可用于单 ...

2024-04-21 已阅读: n次

ngsph

ngsphy是一个python开源工具，用于在全基因组范围内模拟从普通物种树下进化的数千个基因家族获得的ngs数据（读取计数或illumina读取），每个物种有多个单倍体和/或二倍体个体，其中测序覆盖 ...

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spsearch

spsearch python工具从各种api获取物种数据，包括iucn red list和生命百科全书。什么是spsearch？这是一组cli工具，使您能够轻松地使用各种api。为什么选择sp ...

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smetana

斯梅塔纳物种代谢相互作用分析（smetana）是基于python的用于分析微生物群落的命令行工具。它以微生物群落作为输入（来自 sbml格式的基因组规模代谢模型）和几个描述交互作用潜力的指 ...

2024-04-21 已阅读: n次

htsint

使用无监督聚类创建基因集的包。基因集是基于一个或多个物种的基因本体信息生成。 ...

2024-04-21 已阅读: n次

bvatar

bvatar创建字符串的唯一8x8图形表示。设置从pypi安装使用以下pip命令安装： pip install bvatar 或者，如果希望能够创建位图图像，请改用此选项： pip ins ...

2024-04-21 已阅读: n次

pychemkin

pychemkin是一个python 3化学动力学库。核心功能是计算参与反应系统的所有物种的反应速率。新的扩展功能现在允许将反应速率和浓度作为时间的函数进行计算和可视化，以便于理解系统运行的时间尺度、 ...

2024-04-21 已阅读: n次

chemspectranslator

chemspectranslator是化学机制物种的通用翻译程序根据比尔·卡特（加州大学河滨分校）最初构想的主电子表格，改编自Christoph Knote（慕尼黑音乐学院）/Louisa Emm ...

2024-04-21 已阅读: n次

PYroMat

pyromat提供了一个python接口，用于900多种物种的热物理特性。有关更多文档、安装选项和更多信息，请访问pyromat主页（http://pyromat.org）。 ...

2024-04-21 已阅读: n次

brocc

brocc 从blast结果生成基于一致性的分类分配。使用brocc时请引用以下文件： Dollive S、Peterfreund GL、Sherrill Mix S、Bittinger K、Sin ...

2024-04-21 已阅读: n次

powerball

powerball：细菌群竞争抽奖分析的工具，由matthew marshall和john l.darcy所著，什么是竞争抽奖分析？一个竞争性的彩票环境是许多物种为了争夺少数地点或斑块的优势而竞争的环 ...

2024-04-21 已阅读: n次

Python 物种

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