通过解锁基因组工具分析和可视化行为数据的库

pergola的Python项目详细描述


CircleCI status

电路状态

用于将行为数据转换为基因组的python库 浏览器兼容格式。一旦行为数据在基因组中格式化 格式使用基因组软件工具进行分析很容易。为了 实例可以使用bedtools查询数据或可视化 使用基因组浏览器的记录(参见下面对应于 小鼠取食行为的绘制 IGV基因组 浏览器)。

有关更多信息,请参阅安装说明和教程 访问:

Pergola documentation

您还可以使用我们仍在开发中的Web服务器:

Pergola web server

Mouse feeding behavior-IGV snapshot

小鼠喂养行为igv快照

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