- 当前热门话题:
Python bedtools
-
本站为您提供最新、最全的bedtools的Python教程、文档、代码、资源等相关内容,Python中文网技术交流社区同时还提供学习资源下载,
如:电子书、IDE编辑器软件、编程视频、代码规范标准、WEB开发、GUI、科学计算与人工智能等相关内容。
本文网址:https://www.cnpython.com/tags/280102
欢迎加入QQ群-->: 979659372
关于bedtools 相关联的Python项目和问题:
最新问答
我正在尝试用python开发一个GUI,用于分析可以在Linux和Windows中运行的tRNA Seq数据。为此,需要运行一些程序,如:bowtie2、samtools或bedtools,anaco ...
已阅读: n次
我不熟悉编程,但有以下问题要解决。我想找到两个文件的交集。在
例如,文件1:
> scaffold1 0 206 transcript_loc.00 ...
已阅读: n次
我想创建一个空的conda环境,但是新创建的环境似乎正在从根环境或其他环境中获取包。我已经将这些包(例如bedtools,bwa等)作为根用户安装在系统上,也安装在其他conda环境中,但是我想创建一 ...
已阅读: n次
我编写了从fastp到gatk\u bqsr的snakemake流,然后在规则索引\u bqsr中遇到了这个问题:
Submitted job 440 with external jobid 'You ...
已阅读: n次
嗨,我有一个关于在python中将输入和输出与子进程链接起来的问题。我试图通过将一个步骤的输出传递给另一个子进程而不是输出到文件来简化程序。然后打开另一个进程在该文件上运行。在
例如,第一个进程使用S ...
已阅读: n次
我正在使用python运行一个名为bedtools的终端程序。Bedtools以文件名作为参数。但是,因为我一次只能打开256个文件,所以我的多线程处理能力有限。我希望能够将内存中的文件发送到终端,但 ...
已阅读: n次
我可以知道如何从fasta文件中提取dna序列吗?我试过床上工具和samtools。Bedtools getfasta做得很好,但是对于我的一些文件返回“警告:在fasta文件中没有发现染色体”,但事 ...
已阅读: n次
我在Windows7上编程,在我的一个Python项目中,我需要调用bedtools,它只在Windows上与Cygwin一起工作。我是Cygwin的新手,安装了bedtools所需的默认版本,然后使 ...
已阅读: n次
最新项目
ngsscriptlibrary
帮助AMC进行NGS数据分析的脚本集合。
先决条件
Zlib和床具:
sudo apt-get install zlib-dev
wget https://githu ...
已阅读: n次
蛇形刻度
数据管道语言snakemake的非严格包装。
❯ pip install 'snakescale[full]'
功能:
使用official wrapper reposi ...
已阅读: n次
概述
BEDTools suite of programs是广泛的
用于基因组区间操作或“基因组代数”。pybedtools包装
扩展了bedtools并从内部提供功能级操作
Python。
...
已阅读: n次
NTAI
NTAI代表核苷酸(NT)人工智能(A.I.)。NTAI是一个小的
用于将fasta序列与人工智能(a.i.)结合使用的python库。
目前有两个主要模块将被使用
Codex,和
bed ...
已阅读: n次
电路状态
用于将行为数据转换为基因组的python库
浏览器兼容格式。一旦行为数据在基因组中格式化
格式使用基因组软件工具进行分析很容易。为了
实例可以使用bedtools查询数据或可视化
使用 ...
已阅读: n次