pergenie是一个用于个人基因组解释的web/cui应用程序。

pergenie的Python项目详细描述


perGENIE个人基因组解释。此存储库包含 pergenie的核心实用程序,如Disease Risk Report

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快速入门(非开发人员)

无需安装,只需下载此存储库并运行:

$ python ./pergenie [command][options]

用法示例

运行Disease Risk Report

$ python ./pergenie riskreport -I example/vcf_whole_genome.vcf \
                               -F vcf_whole_genome \
                               -P Asian

对于开发人员

如何安装

如果你熟悉pip

$ pip install pergenie

或者克隆此存储库,然后按安装脚本安装:

$ python setup.py install

如何运行测试

$ python setup.py test

许可证

版权所有(C)2012201320142015 Pergenie Team<;knmkr3gma[at]gmail.com>;

pergenie是根据gnu agplv3.0授权的。

AGPLv3

更改日志

  • 0.1.0条 -初始版本
  • 0.1.1条 -更新自述文件
  • 0.1.2条 -将许可证更改为AGPLv3
  • 0.1.3条 -将readme.md重写为.rst

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