神经时间序列相位幅度耦合(pac)的估计,包括驱动自回归(dar)模型。
pactools的Python项目详细描述
一开始使用pactools
图片::https://travis-ci.org/pactools/pactools.svg?branch=master
:目标:https://travis ci.org/pactools/pactools
:alt:Build Status
图像::https://codecov.io/gh/pactools/pactools/branch/master/graph/badge.svg
:目标:https://codecov.io/gh/pactools/pactools
:alt:测试覆盖率
图片::https://img.shields.io/badge/python-2.7-blue.svg
:目标:https://github.com/pactools/pactools
:alt:python27
图像::https://img.shields.io/badge/python-3.6-blue.svg
:目标:https://github.com/PAC tools/pactools
:alt:Python36
此包提供了在神经时间序列中估计**相位-幅度耦合(PAC)**
的工具它实现了**驱动的自回归(dar)**
模型,这些模型出现在下面的参考文献中[`dupre la tour et al.2017年`.
请阅读`文档<;https://pactools.github.io>;` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` `安装` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` `,首先需要安装` ` ` ` ` ` ` ` `您还需要安装可选软件包:
然后使用以下两个命令之一安装“pactools”:
-开发版本::
-最新稳定版本::
pip installpactools
若要升级,请使用由“pip”提供的“upgrade”标志。
检查是否一切正常,您可以执行以下操作:
,它不应给出任何错误消息。
Phase amplitude coupling频率振荡-是目前为止公认的最大的频率振荡。
pac通常用共模图表示,它显示了在频率网格上耦合的强度。
在“pactools”中,可以用10种不同的方法计算共模图。
整个频谱同时避免了与不正确滤波或对宽带信号使用hilbert变换有关的
陷阱。由于该模型是概率模型,它还通过似然性提供了模型**拟合优度**的
得分,使得
模型的选择和参数比较更为简单合理;
这种数据驱动的特性是这种基于模型的方法所独有的。
我们建议使用dar模型来估计神经时间序列中的pac。
更多详细信息,请参见[`dupre la tour等人。2017年`.
瓦莱丽·道耶,亚历山大格拉夫特和维吉尼亚·范瓦森霍夫,请不要引用,如果你在你的项目中使用这个代码,请引用2017年:
…代码块:
@article{dupretaur2017非线性,
author={dupr{'e}la tour,tom and tallot,lucille and grabot,laetitia and doy{'e}re,val{'e}rie and van wassenhove,virginie and grenier,yves and gramfort,alexandre},
journal={plos computational biology},
publisher={public library of science},
title={neural time series}中跨频率耦合的非线性自回归模型,
year={2017},
month={12},
volume={13},
url={https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005893},
pages={1-32},
number={12},
doi={10.1371/journal.pcbi.1005893}
}
……_杜普雷拉图尔等人。2017年:http://journals.plos.org/ploscompbiol/article?ID=10.1371/journal.pcbi.1005893
图片::https://travis-ci.org/pactools/pactools.svg?branch=master
:目标:https://travis ci.org/pactools/pactools
:alt:Build Status
图像::https://codecov.io/gh/pactools/pactools/branch/master/graph/badge.svg
:目标:https://codecov.io/gh/pactools/pactools
:alt:测试覆盖率
图片::https://img.shields.io/badge/python-2.7-blue.svg
:目标:https://github.com/pactools/pactools
:alt:python27
图像::https://img.shields.io/badge/python-3.6-blue.svg
:目标:https://github.com/PAC tools/pactools
:alt:Python36
此包提供了在神经时间序列中估计**相位-幅度耦合(PAC)**
的工具它实现了**驱动的自回归(dar)**
模型,这些模型出现在下面的参考文献中[`dupre la tour et al.2017年`.
请阅读`文档<;https://pactools.github.io>;` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` `安装` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` ` `,首先需要安装` ` ` ` ` ` ` ` `您还需要安装可选软件包:
然后使用以下两个命令之一安装“pactools”:
-开发版本::
-最新稳定版本::
pip installpactools
若要升级,请使用由“pip”提供的“upgrade”标志。
检查是否一切正常,您可以执行以下操作:
,它不应给出任何错误消息。
Phase amplitude coupling频率振荡-是目前为止公认的最大的频率振荡。
pac通常用共模图表示,它显示了在频率网格上耦合的强度。
在“pactools”中,可以用10种不同的方法计算共模图。
整个频谱同时避免了与不正确滤波或对宽带信号使用hilbert变换有关的
陷阱。由于该模型是概率模型,它还通过似然性提供了模型**拟合优度**的
得分,使得
模型的选择和参数比较更为简单合理;
这种数据驱动的特性是这种基于模型的方法所独有的。
我们建议使用dar模型来估计神经时间序列中的pac。
更多详细信息,请参见[`dupre la tour等人。2017年`.
瓦莱丽·道耶,亚历山大格拉夫特和维吉尼亚·范瓦森霍夫,请不要引用,如果你在你的项目中使用这个代码,请引用2017年:
…代码块:
@article{dupretaur2017非线性,
author={dupr{'e}la tour,tom and tallot,lucille and grabot,laetitia and doy{'e}re,val{'e}rie and van wassenhove,virginie and grenier,yves and gramfort,alexandre},
journal={plos computational biology},
publisher={public library of science},
title={neural time series}中跨频率耦合的非线性自回归模型,
year={2017},
month={12},
volume={13},
url={https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005893},
pages={1-32},
number={12},
doi={10.1371/journal.pcbi.1005893}
}
……_杜普雷拉图尔等人。2017年:http://journals.plos.org/ploscompbiol/article?ID=10.1371/journal.pcbi.1005893