将人类mtdna序列转化为变异位点，反之亦然。
oldowan.mtconvert的Python项目详细描述
mtconvert是一个小型、纯python的生物信息实用程序，用于（1）将人类有丝分裂软骨dna序列数据转换为相对于修订的剑桥参考序列（rcrs）的变异位点，以及（2）将变异位点数据转换为dna序列。关于人类mtdna序列的rcrs和变异位点的更多信息，请访问mtconvert网站。
最简单的安装方法是使用
setuptools\u包中的“easy\u install”。这通常是这样的：：
$easy_install oldowan.mtconvert
或在类unix系统上，假设您是以非特权用户的身份安装到主python
``site packages``目录，则此：：
$sudo easy_install oldowan.mtconvert
您还可以使用标准python distutils安装方法。从本页底部的文件列表中下载
当前源文件存档，将其取消存档，然后安装。在Mac OS X和许多其他类似Unix的系统上，下载了存档文件并将其更改到shell中包含此存档文件的目录后，可能会出现以下情况：
$tar xvzf oldowan.mtconvert*
$cd oldowan.mtconvert*
$python setup.py install
quick start
==``以及来自oldowan.mtconvert的“sites2seq”：
>；>；来自oldowan.mtconvert导入seq2sites，sites2seq
>；>；将序列转换为sites:：
>；seq=“”ttcttgaggaagttggtaccacca
gtattgactcaccaccaccaccaccacacacacaccctatgttcgtacattactgcc
agccaccatgaatactagtaccatacacacacccattagt
acataaaacacacatccaaaccccccctcataccataccaaagca
agtaccaaacccataccacccaaccataccaaacagt
acatagtataaaagccattacgtacatagcatacatacattacagtcaatc
ccttctcgtcc“
>>>seq2站点（seq）
序列必须连续！必须单独分析序列的单独运行，如hvr1和hvr2
而无中间序列间隔。
序列中允许的周围位点（n）的数量也有一个截止值。默认情况下，这是10-但这是一个可以设置的选项：
>；>seq2站点（seq，ambig_cutoff=20）
返回
的默认序列区域是高变量区域1（hvr1），即rcr的位置16024到16365
（在基于生物的编号中）：
>；sites2seq（'16129a 16223t'）
预定义的序列区域是：
-hvr1:16024-16365
-hvr2:73-340
-hvr1到2:16024-340
-编码：577-15992
-全部：1-16559
so，将hvr2站点列表转换为序列：：
>；>；sites2seq（'73g'，region='hvr2'）
站点也可以在列表中提供：
>；>；sites2seq（['16129a'，'16223t'，'73g'，region='hvr1 to 2'）
rcrs序列将在给定空字符串、空列表或
字符串“rcrs”的情况下返回。所有这些都是等效的：
>；>sites2seq（''
>；>sites2seq（[]）
>；>sites2seq（'rcrs'）
>可以通过将站点列表传递给
``region``选项来选择任意位置：
>；
python range函数对此很方便，但您必须记住
范围不包括其结束位置：：
>；>；sites2seq（''，region=range（73341））；包括340，但不包括341
2009年）
模块的初始版本。
1.0.1（2009年3月25日）
小版本修复
1.0.2（2009年5月27日）
部分RFLP实现
<1.0.3（2015年6月22日）
在查询结束时添加虚假删除修复
1.0.4（2015年6月22日）
在查询结束时改进虚假删除修复
1.0.5（2015年6月22日）
请求区域外的站点应无提示通过；插入修复
1.0.6（8月4日，2015）
修复版本号安装问题
…_设置工具：http://peak.telecommunity.com/devcenter/easyinstall
最简单的安装方法是使用
setuptools\u包中的“easy\u install”。这通常是这样的：：
$easy_install oldowan.mtconvert
或在类unix系统上，假设您是以非特权用户的身份安装到主python
``site packages``目录，则此：：
$sudo easy_install oldowan.mtconvert
您还可以使用标准python distutils安装方法。从本页底部的文件列表中下载
当前源文件存档，将其取消存档，然后安装。在Mac OS X和许多其他类似Unix的系统上，下载了存档文件并将其更改到shell中包含此存档文件的目录后，可能会出现以下情况：
$tar xvzf oldowan.mtconvert*
$cd oldowan.mtconvert*
$python setup.py install
quick start
==``以及来自oldowan.mtconvert的“sites2seq”：
>；>；来自oldowan.mtconvert导入seq2sites，sites2seq
>；>；将序列转换为sites:：
>；seq=“”ttcttgaggaagttggtaccacca
gtattgactcaccaccaccaccaccacacacacaccctatgttcgtacattactgcc
agccaccatgaatactagtaccatacacacacccattagt
acataaaacacacatccaaaccccccctcataccataccaaagca
agtaccaaacccataccacccaaccataccaaacagt
acatagtataaaagccattacgtacatagcatacatacattacagtcaatc
ccttctcgtcc“
>>>seq2站点（seq）
序列必须连续！必须单独分析序列的单独运行，如hvr1和hvr2
而无中间序列间隔。
序列中允许的周围位点（n）的数量也有一个截止值。默认情况下，这是10-但这是一个可以设置的选项：
>；>seq2站点（seq，ambig_cutoff=20）
返回
的默认序列区域是高变量区域1（hvr1），即rcr的位置16024到16365
（在基于生物的编号中）：
>；sites2seq（'16129a 16223t'）
预定义的序列区域是：
-hvr1:16024-16365
-hvr2:73-340
-hvr1到2:16024-340
-编码：577-15992
-全部：1-16559
so，将hvr2站点列表转换为序列：：
>；>；sites2seq（'73g'，region='hvr2'）
站点也可以在列表中提供：
>；>；sites2seq（['16129a'，'16223t'，'73g'，region='hvr1 to 2'）
rcrs序列将在给定空字符串、空列表或
字符串“rcrs”的情况下返回。所有这些都是等效的：
>；>sites2seq（''
>；>sites2seq（[]）
>；>sites2seq（'rcrs'）
>可以通过将站点列表传递给
``region``选项来选择任意位置：
>；
python range函数对此很方便，但您必须记住
范围不包括其结束位置：：
>；>；sites2seq（''，region=range（73341））；包括340，但不包括341
2009年）
模块的初始版本。
1.0.1（2009年3月25日）
小版本修复
1.0.2（2009年5月27日）
部分RFLP实现
<1.0.3（2015年6月22日）
在查询结束时添加虚假删除修复
1.0.4（2015年6月22日）
在查询结束时改进虚假删除修复
1.0.5（2015年6月22日）
请求区域外的站点应无提示通过；插入修复
1.0.6（8月4日，2015）
修复版本号安装问题
…_设置工具：http://peak.telecommunity.com/devcenter/easyinstall
欢迎加入QQ群-->： 979659372
