nmrml2isa解析器的pyqt接口。
nmrml2isa-qt的Python项目详细描述
nmrml2isa qt
===br/>
nmrml2isa解析器的pyqt接口,用于nmrml2isa解析器的pyqt接口。分析程序。它提供了一个易于使用的界面,可以将nmrml文件转换为isa tab研究。它是用python3和pyqt5制作的。
代码::bash
pip3安装nmrml2isa qt
代码::bash
git clone git://github.com/althonos/nmrml2isa qt
代码::bash
python3 run.py
代码::bash
cd nmrml2isa qt&;python3 setup.py install
使用
--
使用“nmrml2isa qt”命令打开gui。要简单地将**.nmrml**
文件解析到**isa**,请选择包含文件的目录。使用
默认设置,程序将在该
文件夹中创建新的isa文件,假设该文件夹的名称是研究标识符(*mtbslxxx*
,例如用于代谢研究)。这可以通过取消勾选
“将结果导出到每个研究的目录”框来更改。设置参数
后,单击“转换”按钮启动解析器。
要向最终的isa选项卡文件提供更多的元数据,请使用“添加元数据”按钮打开一个新窗口并更新研究的详细信息。尽管如此,
即使填写了所有必需的字段,**生成的isa也需要在解析结束后进行增强**(例如使用
`metabolight pre-packated isa
creator<;http://www.ebi.ac.uk/metabolights/>;`_添加缺失的字段)。
新陈代谢上传所需的缺失信息目前为:
-研究因素(取决于样本,必须添加到*研究*文件
和*研究*文件中)
-代谢物分配文件
-研究设计
todo
----
-向主窗口添加“代谢物分配文件”字段或更改**nmrml2isa**解析器行为,以便成功检测代谢物分配文件和将它们添加到研究文件中。
许可证
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文件 代码 bash 解析器 qt pyqt 代谢物 isa nmrml nmrml2isa
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nmrml2isa解析器的pyqt接口,用于nmrml2isa解析器的pyqt接口。分析程序。它提供了一个易于使用的界面,可以将nmrml文件转换为isa tab研究。它是用python3和pyqt5制作的。
代码::bash
pip3安装nmrml2isa qt
代码::bash
git clone git://github.com/althonos/nmrml2isa qt
代码::bash
python3 run.py
代码::bash
cd nmrml2isa qt&;python3 setup.py install
使用
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使用“nmrml2isa qt”命令打开gui。要简单地将**.nmrml**
文件解析到**isa**,请选择包含文件的目录。使用
默认设置,程序将在该
文件夹中创建新的isa文件,假设该文件夹的名称是研究标识符(*mtbslxxx*
,例如用于代谢研究)。这可以通过取消勾选
“将结果导出到每个研究的目录”框来更改。设置参数
后,单击“转换”按钮启动解析器。
要向最终的isa选项卡文件提供更多的元数据,请使用“添加元数据”按钮打开一个新窗口并更新研究的详细信息。尽管如此,
即使填写了所有必需的字段,**生成的isa也需要在解析结束后进行增强**(例如使用
`metabolight pre-packated isa
creator<;http://www.ebi.ac.uk/metabolights/>;`_添加缺失的字段)。
新陈代谢上传所需的缺失信息目前为:
-研究因素(取决于样本,必须添加到*研究*文件
和*研究*文件中)
-代谢物分配文件
-研究设计
todo
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-向主窗口添加“代谢物分配文件”字段或更改**nmrml2isa**解析器行为,以便成功检测代谢物分配文件和将它们添加到研究文件中。
许可证
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