cuda加速python实用程序,用于高吞吐量pet/mr图像处理和分析。

nimpa的Python项目详细描述


Documentation Status

nimpa是一个由{a2}组成的独立python子包,致力于对大脑图像,特别是那些使用正电子发射断层扫描(pet)和磁共振(mr)获得的图像进行高通量处理和分析。尽管nimpa是无缝pet图像重建的{a2}包的重要组成部分,但它同样非常适合独立的图像处理,包括图像修剪、上采样和部分体积校正(pvc)。

当使用全身pet扫描仪时,为了减少大脑成像中未使用的图像体素,只使用部分视野(fov)。

为了使用感兴趣区域(roi)更精确地提取(采样)pet数据,需要进行上采样,该感兴趣区域是通过对相应的t1w-mr图像(通常具有更高的图像分辨率)进行分段而获得的。

需要PVC来校正来自定义的ROI(特定于任何给定应用)的PET信号的漏入和漏出。

为了方便这些操作,nimpa依赖第三方软件从dicom到nifti(dcm2niix)的图像转换和图像注册(niftyreg)。附加软件将自动安装到用户指定的位置。

包含安装手册和教程的文档https://niftypet.readthedocs.io/

作者:pawel j.markiewicz@university college london

版权所有2018

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
Gson类中的java验证错误   If和elseif之间的java差异?   字典Java8地图。输入比较器   java连接到远程计算机以获得WMI支持   java如何使用改型处理JSON对象中的空值   在Java中使用Comparator时不可编译的源代码   java将Jar添加到JSP的运行时路径   带有随机对象的while循环的java大O时间复杂性   java可以在不考虑参数的情况下模拟方法吗?   java我有一个简单的代码,它不工作。无法修复错误“println”   向eclipse添加Xively java库   java是否可以启用本机代码的缓存?   全局变量如何在Java中的所有类之间共享要使用的语言环境?   Java内存游戏如何翻转单个卡?