mpi4py-fft 2.0.3

mpi4py fft

MPI4PY FFT是一个用于计算快速傅立叶变换（FFT）的Python包。 大型阵列是分布式的，通信由 python的mpi（mpi4py）。要分发大型阵列，我们使用 new and completely generic algorithm 它允许分布多维数组的任何索引集。我们 只能分布一个索引（一个板分解），两个索引集（铅笔 分解）或更高维数组。

mpi4py fft带有自己的python接口 FFTW库。此接口可以使用 很像pyfftw，甚至 实到实变换，如离散余弦或正弦变换。

更多文档可在readthedocs找到。

安装

mpi4py fft包可以使用以下命令安装：

pip install mpi4py-fft

或者，要从BitBucket获取最新版本：

pip install git+https://bitbucket.org/mpi4py/mpi4py-fft@master

使用Coda Forge通道中的Conda进行安装：

conda install -c conda-forge mpi4py-fft

或者使用conda build从主源目录构建它：

conda build -c conda-forge conf/
conda create --name mpi4py_fft mpi4py_fft --use-local

它将从conda forge通道中拉入所需的依赖项。

注意，mpi4py fft依赖于python包

• mpi4py
• numpy
• cython

以及串行C库

• FFTW

特别注意mpi4py要求 使用编译器包装器mpicc在搜索路径上安装mpi。 fftw头和库也必须在搜索路径上可用，并且 我们将为fftw库找到的任何精度构建包装器。

以上所有依赖项都可用，并将通过 如果康达用于安装，康达锻造通道。不过，皮普 对MPI或FFTW没有帮助。

对于IO，您需要安装h5py或 netCDF4支持 MPI。第一个可以从Coda Forge频道通过：

conda install -c conda-forge h5py=*=mpi_mpich_*

另一方面，netcdf4在conda forge上没有mpi 频道。不过，osx和 来自spectralDNS通道的Linux 在水蟒云上：

conda install -c spectralDNS netcdf4-parallel