图案出现检测套件

MOODS-python的Python项目详细描述


moods python 1.9.4.1

motif出现检测套件

https://www.cs.helsinki.fi/group/pssmfind/

从pypi安装

安装mood的最快方法是使用pip:

(a)将模块安装到本地python库路径:

pip install --user MOODS-python

(b)为所有用户安装模块:

sudo pip install MOODS-python

从pypi安装moods包将moods-dna.py脚本安装到 您的python可执行目录。通过运行进行测试:

moods-dna.py --help

(注意,这假设适当的python可执行目录在 你的路。例如,如果使用--user安装包,则可以执行以下操作 使用

PATH="$PATH:`python -m site --user-base`/bin"

否则不起作用。)

从源安装

或者,您可以从源包安装mood,例如 没有配置pip,或者您只需要快速的一次性安装。

(a)如果不想麻烦安装mood,可以编译扩展 就位并在scripts/

下创建符号链接
python setup.py build_ext --inplace
cd scripts
ln -s ../MOODS/

(b)将模块安装到本地python库路径:

python setup.py install --user

(c)为所有用户安装模块:

sudo python setup.py install

您可以通过运行moods-dna.py脚本来测试情绪 包中提供的示例数据:

cd scripts/
python moods-dna.py -m example-data/matrices/*.{pfm,adm} -s example-data/seq/chr1-5k-55k.fa -p 0.0001
python moods-dna.py --help

文档

github wiki上的文档:https://github.com/jhkorhonen/MOODS/wiki

版权和许可

版权所有(c)2009 Petri J Martinm_ki,Janne Korhonen,Pasi Rastas

此程序是免费软件:您可以重新分发和/或修改 根据由 自由软件基金会,或者许可证的第3版,或者 (根据你的选择)任何更高版本,或根据Biopython的条款 执照。

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
添加组件后,java JTable为空   java将json发送到php并插入mysql,但返回null   java Spring引导JNDI CommonJ资源   从不同PC创建和合并后的Java servlet问题   java如何在使用findelements时从xpath获取文本   java使用spring boot使用gmail smtp发送电子邮件   java在不使用pojo、bean或getter和setter的情况下获取Json标题的Json数组   Java中的OpenFile对话框将null作为响应   JavaBuilder模式。扩展接口   java中无需替换的数据结构选取   java如何评价Encog中的预测神经网络   java如何在安卓中使用实际的HttpURLConnection进行单元测试?   java使用XML配置禁用WebSocket中的CSRF保护   java如何通过hibernate从多表查询中获取数据?   mysql如何在java中获取更新的行Id   java AEM/CQ组件单一组件/有限组件   java FFmpeg Javacv延迟问题   显示整数数组的java不起作用