mbin 1.1.1

mbin概述

mbin：一个基于甲基化的亚基因组smrt测序binning框架读取

mbin管道的设计是为了发现亚基因组smrt测序读取中dna甲基化的独特信号，并利用它们将组装好的contig或未组装好的read组合起来。由于all细胞dna被基因组中编码的同一组甲基转移酶修饰，因此dna甲基化信号不仅可以用于染色体序列的结合，还可以用于染色体外的可移动遗传元素，如质粒。

管道由四个例程组成：

1. buildcontrols：从全基因组扩增（wga）测序中获取基序的非甲基ipd值
2. filtermotifs：识别原生亚基因组测序中的甲基化基序
3. methylprofiles：使用指定的基序为序列创建甲基化简档
4. mapfeatures：可视化所有序列中甲基化特征的情况

历史记录

1.0.0（2017-06-13）

• pypi上的第一个版本。