k-bags卷积神经网络(kcon)支持的分子动力学(md)模拟。
kconmd的Python项目详细描述
kconmd(k袋卷积神经网络分子动力学)
由k-Bags Convolutional Neural Network (kCON)支持的分子动力学(md)模拟。
作者:曾金哲
确认
要求
安装
pip
pip install kconmd
从源构建
$ git clone https://github.com/njzjz/kconmd
$ cd kconmd/
$ pip install .
示例
简单示例
客户机-服务器模式
见examples/server.py和examples/client.py。
与lammps一起运行md
请参阅njzjz/Pyforce存储库并安装pyforce模块。然后将examples/client.py重命名为force.py
,并将其放在运行lammp的地方。在lammps输入文件中添加一行:
fix 1 all pyforce C H O