用于系统发育的交互式可视外壳
ivy-phylo的Python项目详细描述
ivy是一个轻量级库和交互式可视化编程 系统发育环境。它建立在强大的基础之上。 包括numpy,scipy, matplotlib和ipython。
ivy强调 系统发育树。例如:
#!/usr/bin/env ipython from ivy.interactive import * root = readtree("primates.newick") fig = treefig(root)
文档和其他资源
安装
- 安装virtualenv。
- 安装常春藤:pip install ivy