孟德尔遗传模型
inheritance的Python项目详细描述
孟德尔病遗传模型[构建状态]（https://travis-ci.org/brentp/heritance.svg？分支（=主）]（http://特拉维斯Ci.org/Brutp/继承）
BR/>此模块是一个通用的框架，用于评估一个族的外显子，例如，以及常染色体显性模式。
这一逻辑在[gemini]中进行了调整（https://github.com/arq5x/gemini），但我们在这里提供了一个更通用的库来鼓励：
1。社区推动的改善
2.在双子座以外使用
3.更全面的测试，例如，在三个个体中找到与常染色体显性相匹配的变异非常简单，但是，在考虑了多代、任意家族大小、深度截断后，未知的
基因型和表型支持现实世界的数据集变得乏味和容易出错。
支持的遗传测试
=========
+常染色体显性
+常染色体隐性
+从头
+x连锁显性，隐性，而从头开始的
+复合杂合子
+孟德尔破坏
用户可以查看测试以了解如何使用。大多数函数都有这样的签名：
Byth> Byth/Br/> AutoDoM（自我，MythLe=＝0，GtayLL= false，严格= true，OnLyEffely= true）
'BR/> BR/>其中参数执行最小深度、最大基因型似然性、严格性（主要与亲子要求有关）BR/>以及允许未受影响者具有变体（或）。是纯合的alt）。很快增加对x-linked的支持。
2.添加一个在vcf+ped上运行的简单示例
3。代码覆盖率
4。代码文档
测试
==
测试可以运行为：
````
noests--with coverage-x--with doctest--cover package inheritance
```
overview
=
`继承/pyeval.py`.
要使其可用于新资源，例如“bcftools”，我们将在“继承/pyval.py`
中查看filter的实现，并使生成的字符串与“bcftools”所期望的字符串相匹配。
BR/>此模块是一个通用的框架，用于评估一个族的外显子，例如，以及常染色体显性模式。
这一逻辑在[gemini]中进行了调整（https://github.com/arq5x/gemini），但我们在这里提供了一个更通用的库来鼓励：
1。社区推动的改善
2.在双子座以外使用
3.更全面的测试，例如，在三个个体中找到与常染色体显性相匹配的变异非常简单，但是，在考虑了多代、任意家族大小、深度截断后，未知的
基因型和表型支持现实世界的数据集变得乏味和容易出错。
支持的遗传测试
=========
+常染色体显性
+常染色体隐性
+从头
+x连锁显性，隐性，而从头开始的
+复合杂合子
+孟德尔破坏
用户可以查看测试以了解如何使用。大多数函数都有这样的签名：
Byth> Byth/Br/> AutoDoM（自我，MythLe=＝0，GtayLL= false，严格= true，OnLyEffely= true）
'BR/> BR/>其中参数执行最小深度、最大基因型似然性、严格性（主要与亲子要求有关）BR/>以及允许未受影响者具有变体（或）。是纯合的alt）。很快增加对x-linked的支持。
2.添加一个在vcf+ped上运行的简单示例
3。代码覆盖率
4。代码文档
测试
==
测试可以运行为：
````
noests--with coverage-x--with doctest--cover package inheritance
```
overview
=
`继承/pyeval.py`.
要使其可用于新资源，例如“bcftools”，我们将在“继承/pyval.py`
中查看filter的实现，并使生成的字符串与“bcftools”所期望的字符串相匹配。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
