从同位素稀释代谢组学数据中提取非目标特征的应用程序。
idms-pairfinder-2的Python项目详细描述
EMZED2在轨道式高质量分辨率仪器采集LC-MS数据中的应用。
该应用允许基于同位素稀释的代谢物无目标提取 质谱法。对于每种代谢物,一对天然标记的[12c]和 同一样品中存在均匀的13C标记的[13C]同位素,因为样品是 各细胞提取物的混合物。 由于未标记同位素和标记同位素具有相同的物理化学性质,因此 LC-MS峰将被共洗脱,m/z差等于
n*(mz.c13-mz.c12)*z
其中n相当于代谢物碳原子的数量, m z.c12是12c同位素的m/z,mz.c13等于相应13c同位素的m/z, z是离子的电荷态。 此外,非靶向代谢物提取不仅基于对idms样品的分析, 同时对相应的[12c]和[13c]提取物的单个LC-MS测量, 分别是。单独的分析可以直接分配同位素同一性([12c],[13c]) 在idms样本中。 总的来说,这种方法显著减少了假阳性代谢物的数量 并增强了代谢物注释,因为碳原子的数量可以通过 同位素质量距离。