Python 组学_专题 - Python中文网

当前热门话题： Python 组学: 本站为您提供最新、最全的组学的Python教程、文档、代码、资源等相关内容，Python中文网技术交流社区同时还提供学习资源下载，如：电子书、IDE编辑器软件、编程视频、代码规范标准、WEB开发、GUI、科学计算与人工智能等相关内容。

本文网址：https://www.cnpython.com/tags/251230
欢迎加入QQ群-->： 979659372

关于组学相关联的Python项目和问题：

如何突出显示wx网格？

我正在写一个蛋白质组学覆盖分析工具（如果你不知道那是什么，它看起来是something like this）。基本上，我必须呈现大量明显随机的文本，并突出其中的各个部分。我用的是wx.网格禁用单元格轮 ...

2024-04-23 已阅读: n次

蛋白质组学的子网络分析

背景：我有来自7个样本的蛋白质组学数据（pvalue/log fold change），我想通过网络（interactome）分析来分析这些数据问：我想从数据中创建一个所有蛋白质的相互作用组，并将这 ...

2024-04-23 已阅读: n次

医学影像学（放射医学）。广州文件夹

我正在尝试实施该方案： https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/usage.html 它看起来非常简单，但是他们需要.nrrd文件。我的文件。广州. ...

2024-04-23 已阅读: n次

mummichog

mummichog是一个python程序，用于分析来自高吞吐量、无目标代谢组学的数据。它利用代谢网络的组织直接从特征表预测功能活动，绕过代谢产物识别。其特点包括*计算显著丰富的代谢途径*识别代谢网络中 ...

2024-04-23 已阅读: n次

camprot

camprot：计算蛋白质组学的脚本和模块 ...

2024-04-23 已阅读: n次

msstitch

#msstitch–ms蛋白质组学后处理实用程序鸟枪蛋白质组学有许多可用于鉴定的生物信息学工具以及肽的定量，以及随后的蛋白质推断。这些脚本是为数年前在组合时搔痒而编写的现有的工具，并充当小命令 ...

2024-04-23 已阅读: n次

mzStudio

质谱/蛋白质组学数据分析应用此包Python名称：mzStudio 目前版本： mzStudio 0.9.9.1 最后维护时间：J ...

2024-04-23 已阅读: n次

mummichog1

代谢组学数据的路径与网络分析此包Python名称：mummichog1 目前版本： mummichog1 1.0.11 最后维护时 ...

2024-04-23 已阅读: n次

m2aligner

M2Aligner可以从单独处理的LC-MS数据集中找到匹配的特征，通过相同的LC-MS方法找到匹配的特征，并创建单个数据集。 ...

2024-04-23 已阅读: n次

dimsp

python包处理基于代谢组学和脂质组学的直接输注质谱数据文档：https://computational-metabolomics.github.io/dimspy 来源：https://gi ...

2024-04-23 已阅读: n次

mitre

Mitre从微生物组学患者预后的预测模型以可解释规则短列表形式提供的时间序列数据： https://github.com/gerberlab/mitre ...

2024-04-23 已阅读: n次

BioDendro

生物树突 a包，用于对代谢组学数据进行聚类，并绘制树状图背景项目负责人：凯瑟琳·罗林森（博士生）电子邮件：catherine.rawlinson@postgrad.curtin.edu.au ...

2024-04-23 已阅读: n次

pyProCT

pyproct是一个开源的聚类分析软件，特别适用于与结构蛋白质组学相关的工作。它的方法允许用户根据自己的领域知识定义一个聚类目标（聚类假设）。这一假设将指导软件找到最佳算法和参数（包括簇的数量），以获 ...

2024-04-23 已阅读: n次

ms1searchp

ms1searchpy-LC-MS1光谱的蛋白质组学搜索引擎脚本的基本操作需要.tsv（或mzml）和.fasta文件。 tsv文件是一个标签分离的文本文件，带有由恐龙软件（j.teleman等人 ...

2024-04-23 已阅读: n次

BTM

解释血液转录组学数据的基因模块。作为传统途径的替代品，提供颗粒免疫和更好的敏感性。这些模块也可以作为基因集用于gsea分析。这是中描述的BTM模块 https://www.nature.com/ ...

2024-04-23 已阅读: n次

glyxtoolms

glyxtoolms提供a）糖肽分析脚本在openms蛋白质组学框架内（使用toppas管道以及用于进一步手动分析结果的可视化/评估工具。源代码位于https://github.com/glyX ...

2024-04-23 已阅读: n次

diffacto

要求 AnacondaPython3.5+ 所需套餐：纽比1.10+ scipy 0.17+ 熊猫0.18+ 网络x 1.10+ SCIKIT学习0.17+ pyteomics3.3+ 通过 ...

2024-04-23 已阅读: n次

cubicweb-genomics

基因组学数据立方体是脑组学项目的一部分。 ...

2024-04-23 已阅读: n次

cptac

cptac 该项目旨在促进从国家癌症研究所cptac联合会获取癌症数据并与之交互，该联合会描述和研究肿瘤的蛋白质基因组景观。目前，可用的数据集有：子宫内膜癌、卵巢癌和结肠癌。这些癌症研究可以通过我们的 ...

2024-04-23 已阅读: n次

idms-pairfinder-2

EMZED2在轨道式高质量分辨率仪器采集LC-MS数据中的应用。该应用允许基于同位素稀释的代谢物无目标提取质谱法。对于每种代谢物，一对天然标记的[12c]和同一样品中存在均匀的13C标记的[13 ...

2024-04-23 已阅读: n次

driven

用于数据驱动建模和分析的包。它实现了将“组学”数据集成到基因组尺度方法中的最新方法。 ...

2024-04-23 已阅读: n次

metabolinks

Metabolinks是一个python包，它提供了一组用于高分辨率的工具代谢组学数据分析。元计算工具旨在提供一些工具来简化大多数元组学工作流。这些工具是用超高基于代谢组学的分辨率。现在功能 ...

2024-04-23 已阅读: n次

ursgal

通用python模块，结合通用自下而上的蛋白质组学工具进行大规模分析 ...

2024-04-23 已阅读: n次

Python 组学

关于组学 相关联的Python项目和问题：

关于组学相关联的Python项目和问题：