共聚焦校正和时移检测的基因表达时间序列差异表达检测。
gptwosample的Python项目详细描述
用于使用gptwosample的包
==
这个模块允许用户比较关于不同表达式的两个时间线。
此预测由您使用的协方差函数py:class:`pygp.covar`定义。
这将在python
bin中安装一个脚本gptwosample。在某些情况下,此bin不在$path中,必须包含
额外的内容。
它的功能。
请参阅doc/index.html以获取站点包文件夹中的文档,
请参阅www.python.org以获取更多详细信息。
示例:请参阅
./gptwosample/example s中的“随时可用”示例脚本。(在python site packages文件夹中,请参见www.python.org以了解更多详细信息)
example run:$exdir=gptwosample/examples/$gptwosample-vtpo toy
$exdir/toycondition1.csv$exdir/toycondition2.csv
要查看gptimeshift示例,运行
sh gptimeshift_example.sh
输出将保存在gptimeshift_example/with plots和
results.csv中。如果没有sh,您仍然可以通过
通过“chmod-x gptimeshift_example.sh”修改脚本,然后
通过“./gptimeshift_example.sh”
确保运行“python./examples/generatetoyexamplefiles.py”以
生成示例的玩具数据(如果它们不存在)。
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这个模块允许用户比较关于不同表达式的两个时间线。
此预测由您使用的协方差函数py:class:`pygp.covar`定义。
这将在python
bin中安装一个脚本gptwosample。在某些情况下,此bin不在$path中,必须包含
额外的内容。
它的功能。
请参阅doc/index.html以获取站点包文件夹中的文档,
请参阅www.python.org以获取更多详细信息。
示例:请参阅
./gptwosample/example s中的“随时可用”示例脚本。(在python site packages文件夹中,请参见www.python.org以了解更多详细信息)
example run:$exdir=gptwosample/examples/$gptwosample-vtpo toy
$exdir/toycondition1.csv$exdir/toycondition2.csv
要查看gptimeshift示例,运行
sh gptimeshift_example.sh
输出将保存在gptimeshift_example/with plots和
results.csv中。如果没有sh,您仍然可以通过
通过“chmod-x gptimeshift_example.sh”修改脚本,然后
通过“./gptimeshift_example.sh”
确保运行“python./examples/generatetoyexamplefiles.py”以
生成示例的玩具数据(如果它们不存在)。