go-pca:一种利用先验知识探索基因表达数据的无监督方法

gopca的Python项目详细描述


PyPI versionPython versions supportedLicense
latestBuild Status (master branch)Coverage (master branch)Documentation Status (master branch)
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go-pca(Wagner, 2015)是一种无监督的方法来探索基因 使用先验知识表达数据。这是一个免费的开源软件 用python实现go-pca。

简言之,go-pca将principal component analysis (PCA)nonparametric GO enrichment analysis以便生成签名, 也就是说,一小部分基因既紧密相关又紧密相关 功能相关的。然后它可视化所有 在签名矩阵中的签名,设计用于 易于解释的生物学相关表达 模式。

支持和发展

  • 对于功能请求和错误报告,请在github上创建一个issue
  • 有关技术问题,请随时email
  • 如果您想为go-pca贡献代码,请email和/或创建 Github上的拉取请求。
  • 有关最新更改的列表,请参见 Changelog

如何引用go-pca

如果你在研究中使用go-pca,请引用Wagner (PLoS One, 2015)

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