定位“恰到好处”的基因组区域。
goldilocks的Python项目详细描述
这是什么?
goldilocks 是一个python包,提供定位"有趣"的功能 "有趣"的一些定义的基因组区域。你可以把它导入 脚本,传递序列数据并搜索符合某些条件的子序列 一个或多个样本。
金凤花是为了支持我们的质量调查工作而开发的。 基因测序控制。它被用来快速定位 人类基因组上表达期望变异水平的区域, 这对于以后的变体调用和比较来说是"恰到好处的"。
此后,该软件包变得更加灵活,可用于查找区域 基于其他标准,如GC含量、目标K-MERS的密度, 定义的置信度和缺失的核苷酸。