Annotation finder for genes.

GeneWordSearch的Python项目详细描述


基本目的

此程序接受基因的名称(以多种方式之一,请参阅下面的选项),在包含的数据库中查找注释或由用户生成注释。然后,它将根据子集中的注释频率与数据库中的注释频率对找到的注释进行排序。这是使用scipy的超几何分布函数完成的。

使用命令行界面($gws)将结果以两种格式之一输出到文件中,一种是人类可读的版本(默认),另一种是tsv(tab separate value),以便进一步处理。

这也可以作为gui的webapp运行,这就是为什么需要flask的原因。

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