如何在不丢失格式的情况下在终端中打印df?如何在终端中打印df而不丢失格式? 假设我有这样一个df: In: df Out: TFs No Esenciales Genes regulados Genes Regulados P ...2024-04-27 已阅读: n次
pandas read_table usecols error with“:”我试图使用python pandas read_table函数从文件中读取一定范围的非连续列。为此,我正在努力: df=pd.read_table('genes.fpkm_trackingTest', ...2024-04-27 已阅读: n次
比较数组:根据坐标对TSV文件中的行进行分组我正在尝试使用python2.7.2对包含制表符分隔值列表的文件执行一些操作。有关更多信息,文件格式称为BED,表示一个基因列表,其中每个基因用一行表示。每行的前三个字段表示坐标。另一个字段包含的描述 ...2024-04-27 已阅读: n次
压缩许多只在顺序递增对象中不同的行语句我的代码中有许多语句遵循下面相同的格式。我正在寻找一个方法或内置函数,我可以用它来进一步压缩这些例子,而不是现有的列表理解。示例如下: sample_1_combined = [i for i in ...2024-04-27 已阅读: n次
打印数据帧而不丢失表单如何在不丢失格式的情况下打印df?你知道吗 假设我有这样一个df: In: df Out: TFs No Esenciales Genes regulados Genes Regulad ...2024-04-27 已阅读: n次
这是什么作业?Python我是从《遗传密码》一书中抄袭而来的,我发现了这个任务: childGenes[index] = alternate \ if newGene == childGenes[index] \ ...2024-04-27 已阅读: n次
python搜索一组单词简单地说,我正在寻找一种使用正则表达式而不使用for循环在字符串中搜索一组单词的最快方法。i、 e.有没有办法做到这一点: text = 'asdfadfgargqerno_TP53_dfgnafoq ...2024-04-27 已阅读: n次
为alph创建自定义图例/指南我正试图描绘基因表达水平。基本上,我为每个基因画一个“pyplot.arrow”并用alpha=expression\u level给它上色。表达式级别标准化为0到1之间的值。 现在我想创建一个基于a ...2024-04-27 已阅读: n次
如何在python中生成这样的数组?我试图弄清楚如何在python中实现一个函数来生成这样的数组(请忽略数字相同的事实): [[0101111010, 0101111010,0101111010, 0101111010,01011110 ...2024-04-27 已阅读: n次
Python:“缩进错误:未缩进与任何外部缩进级别不匹配”我只是不知道这是怎么回事。。。 #!/usr/bin/env python # # Bugs.py # from __future__ import division # ...2024-04-27 已阅读: n次
python中的错误-“NoneType”类型的对象没有len()我不确定我的python代码有什么问题: geneid=request.args.get('geneid') sql=text('select * from INFO where name=:iden ...2024-04-27 已阅读: n次
GeneWordSearch 基本目的 此程序接受基因的名称(以多种方式之一,请参阅下面的选项),在包含的数据库中查找注释或由用户生成注释。然后,它将根据子集中的注释频率与数据库中的注释频率对找到的注释进行排 ...2024-04-27 已阅读: n次
scprep 用于在python中加载和预处理生物矩阵的工具。 安装 预处理在pip上可用。在终端中运行以下命令进行安装: pip install --user scprep 或者,可以使用Con ...2024-04-27 已阅读: n次
pybedtools 概述 BEDTools suite of programs是广泛的 用于基因组区间操作或“基因组代数”。pybedtools包装 扩展了bedtools并从内部提供功能级操作 Python。 ...2024-04-27 已阅读: n次
phizz-genes#phizz genes一个小的django应用程序,用于表示基因、转录本、omim表型、别名等]````>-运行python manage.py py migrate`来创建模型35 35 35<` ...2024-04-27 已阅读: n次
hpo-similarit 患者组表型相似性 这估计了一组个体有多可能 表型。要估计这种可能性,我们需要三件事: 一种量化两个个体表型相似性的方法。我们使用最大值 每对 两个先证者的HPO条款。 一种量化两个以上先证者之间相 ...2024-04-27 已阅读: n次
gtfparse gtfparse GTF(基因转移格式)文件的分析工具。 示例用法 将gtf文件的所有行解析为pandas数据帧 from gtfparse import read_gtf # retur ...2024-04-27 已阅读: n次
gtf_to_genes***************************************概述**************************我们需要一种非常快速、轻量级的方法来访问以gtf格式存储的基因数据 ...2024-04-27 已阅读: n次
django-genes基因是一个django应用程序来表示基因。 下载并安装 这个包在pypi中注册为django-genes,是pip 可安装: pip install django-genes 如果在您的 系统,p ...2024-04-27 已阅读: n次
Optivolutionoptivolutionpy 一个Python 3中编写的灵活的遗传算法库。 安装 对于python3,只需运行: $ pip3 install OptivolutionPy 或者克隆此存储库并从项 ...2024-04-27 已阅读: n次
sharepathwasharepathway是一个python包,用于kegg路径丰富分析和多个基因列表。 已经有几十种工具或网络服务器可以使用来自某些高通量实验(如exome seq和rna seq)的候选基因列表进行 ...2024-04-27 已阅读: n次
RnaChipIntegrator 根据峰值数据分析基因,反之亦然 此包Python名称:RnaChipIntegrator 目前版本: RnaChipIntegrator 1.2.0 ...2024-04-27 已阅读: n次