用于比较DNA序列的库(diff、公共块等)
geneblocks的Python项目详细描述
geneblocks是一个比较dna序列的python库。它可用于:
- 在一组dna序列中找到公共块,将其分解(例如,仅对每个公共块进行一次分析或合成)
- 突出显示序列之间的差异(插入、删除、突变)
- 将genbank功能从一个记录转移到另一个共享相似子序列的记录。
在爱丁堡基因组铸造厂,我们使用基因块优化序列组装,探索未注释序列集,或可视化差异。 在序列的不同版本之间,并重新注释来自第三方(如DNA制造商)的记录。
信息
pip安装:
pip install geneblocks
github页
https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/geneblocks
live演示
Transfer Genbank features between records
许可证:麻省理工学院,爱丁堡基因组铸造厂版权所有