基于mri的肿瘤cad研究工具

dwilib的Python项目详细描述


new:切换到python版本3,它现在是必需的,并且在任何地方都是假定的!

支持扩散加权成像(dwi)分析的工具正在开发中 数据,重点是前列腺癌。

该软件是芬兰图尔库Magnetic Resonance Imaging Research Center研究项目的一部分。

注:这是非常建设中。正在编写程序代码 需求基础,用于内部项目的定制需求。它在 同时,程序员也一直在研究这个主题并学习 工具。所以很多地方的代码都很混乱。

功能

  • 以DICOM或自定义ASCII或Matlab格式读取输入数据
  • 进行模型拟合(单指数ADC,峰度,拉伸指数, 双指数)
  • 计算与格里森得分的相关性
  • 计算并比较诊断roc aucs
  • 计算再现性测量值
  • 绘图方案
  • 多切片、多b值dwi dicom文件查看器(使用matplotlib gui 小部件)
  • 用于数据处理任务自动流水线的生成工具

待办事项或正在进行中

  • 改进的文档
  • 改进的构建工具
  • 自主肿瘤描绘/ROI放置
  • 回归分类

要求

  • Python3.4
  • pathlib2(或更新的python)
  • 努比
  • scipy
  • Scikit-Learn

可选要求

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