解析蛋白质二级结构;dssp文件;dssp-api接口;将pdb格式转换为dssp格式
DSSPparser的Python项目详细描述
#dsspparser
[![pypi-version](https://img.shields.io/pypi/v/DSSPparser.svg?style=flat)](https://pypi.org/project/DSSPparser/) [![pypi-python版本](https://img.shields.io/pypi/pyversions/DSSPparser.svg)](https://pypi.org/project/DSSPparser/) [![github-license](https://img.shields.io/github/license/neolei/DSSPparser.svg?style=flat)](./LICENSE.txt)
dsspparser易于解析dssp文件,可以通过[xssp]将pdb格式文件转换为dssp格式文件(http://www.cmbi.ru.nl/xssp/api/),also支持pdb id与dssp格式、hssp格式与序列之间的转换。
##示例
将dssp文件解析为pandas.dataframe
`Python from DSSParser import parser parse_ = parseDSSP('2GW9.dssp') parse_.parse() pddict = parse_.dictTodataframe() `
PDB格式和DSSP格式之间的转换
`Python from DSSPparser import pdbToxssp result = pdbToxssp("2GW9") `
##许可证
在麻省理工学院的许可下发布。