用于使用DOE优化管道的包。
doepipeline的Python项目详细描述
能源部管道
这是另一个管道包。区别doepipeline的是
它使用来自统计的方法来实现管道优化
Design of Experiments (DOE)。
功能
快速入门链接
看看wiki documentation开始使用doepipline。简而言之，开始使用doepline需要以下步骤。
提供了四个示例（包括数据和配置）作为入门帮助；
- de-novo genome assembly
- scaffolding of a fragmented genome assembly
- k-mer taxonomic classification of ONT MinION reads
- genetic variant calling
引用
^ {STR 1 } dodoiPix:一种系统化的多层次多步数据处理工作流优化方法< /强> SvsSon D，Sj OrgRon R，Sundeld，SjodIn A，Trigg J BioXiV-DOI：^ {A12}
关于此软件
doeppipeline是作为一个python包实现的。它是开放源码软件 在MIT license下面。
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