基于限制性组装等的dna克隆模拟

dnacauldron的Python项目详细描述


dna釜是一个python库,用于模拟基于限制的组装操作。提供基因部分和受体载体的序列,DNA釜将计算混合物可能产生的组合。

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DNA釜是为合成生物学应用而编写的,通常用于预测和验证基于零件的装配批次。它使用简单,与biopython配合良好,可以导入和导出genbank(它保留了所有功能),并提供了高级方法,如连接器部件自动选择、线性部件的主干选择、处理大型组合部件时选择构造子集的方法。

信息

pip安装:

pip install dnacauldron

web文档:

https://edinburgh-genome-foundry.github.io/DnaCauldron/

github页

https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/DnaCauldron

现场演示

http://cuba.genomefoundry.org/simulate_gg_assemblies

许可证:麻省理工学院,爱丁堡基因组铸造厂版权所有

更多生物软件

https://raw.githubusercontent.com/Edinburgh-Genome-Foundry/Edinburgh-Genome-Foundry.github.io/master/static/imgs/logos/egf-codon-horizontal.png

dna釜是用于dna设计、制造和验证的合成生物学软件套件的一部分。

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