基于限制性组装等的dna克隆模拟

dnacauldron的Python项目详细描述


dna釜是一个python库,用于模拟基于限制的组装操作。提供基因部分和受体载体的序列,DNA釜将计算混合物可能产生的组合。

[logo]

DNA釜是为合成生物学应用而编写的,通常用于预测和验证基于零件的装配批次。它使用简单,与biopython配合良好,可以导入和导出genbank(它保留了所有功能),并提供了高级方法,如连接器部件自动选择、线性部件的主干选择、处理大型组合部件时选择构造子集的方法。

信息

pip安装:

pip install dnacauldron

web文档:

https://edinburgh-genome-foundry.github.io/DnaCauldron/

github页

https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/DnaCauldron

现场演示

http://cuba.genomefoundry.org/simulate_gg_assemblies

许可证:麻省理工学院,爱丁堡基因组铸造厂版权所有

更多生物软件

https://raw.githubusercontent.com/Edinburgh-Genome-Foundry/Edinburgh-Genome-Foundry.github.io/master/static/imgs/logos/egf-codon-horizontal.png

dna釜是用于dna设计、制造和验证的合成生物学软件套件的一部分。

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
java允许具有不同父类的类扩展类,而无需多重继承   java如何创建动态化的JScrollPane w/JPanel作为客户端?   java如何组织和命名包   在Java中读取属性文件   java无法解释的Android意图行为   在Java中动态执行多个BPEL文件的部署   ssl Java 6 SNI(服务器名称指示)?   java我们可以使用Robot框架自动化web和移动应用程序来执行并行执行   java for star pettern的循环   java为什么BinaryReader在线程中,从netty读取错误的数据包?   在java中将华氏度转换为摄氏度   使用Spark和java处理空值和引号编写CSV文件   Java中已排序日期到块的列表   visual studio代码VSCode Java不是linting或自动完成局部变量,而是自动完成Java快捷方式,如“sysout”