用python绘制dna序列(如genbank)的特征

dna_features_viewer的Python项目详细描述


dna特性查看器是一个python库,用于可视化dna特性,例如来自genbank或gff文件:

some figure

DNA特征查看器自动生成简单而清晰的图,即使对于具有许多重叠特征和长标签的序列也是如此。libray可以很好地处理matplotlib和biopython,并且可以输出许多不同的格式(png、jpeg、svg、pdf),例如用于报表生成或lims接口。

信息

pip安装:

pip install dna_features_viewer

web文档:

https://edinburgh-genome-foundry.github.io/DnaFeaturesViewer/

github页

https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/DnaFeaturesViewer

现场演示

http://cuba.genomefoundry.org/plot-sequence-features

许可证:麻省理工学院,爱丁堡基因组铸造厂版权所有

更多生物软件

https://raw.githubusercontent.com/Edinburgh-Genome-Foundry/Edinburgh-Genome-Foundry.github.io/master/static/imgs/logos/egf-codon-horizontal.png

dna特征查看器是用于dna设计、制造和验证的合成生物学软件套件的一部分。

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