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dgenome的Python项目详细描述


dGenome

dGenome是一个处理基因组坐标的django应用程序

快速启动

  1. 将“dgenome”添加到已安装的应用程序设置中,如下所示:

    INSTALLED_APPS = [
        ...
        'dgenome',
    ]
    
  2. 在项目url.py中包含dgenome urlconf,如下所示:

    url(r'^dgenome/', include((dgenome.urls, 'dgenome'), namespace='dgenome')),
    
  3. 运行python manage.py makemigrations dgenome以创建dgenome模型。

  4. 运行python manage.py migrate以创建dgenome模型。

  5. 使用ucsc gtf文件和脚本插入基因组数据:bin/load_genome_ucsc.py

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