Connor 0.6.1

概述

在分析深部层序天然气数据时，有时很难区分 罕见变异的测序和PCR错误；因此，一些变异可能 被忽略，一些将被识别为不准确的变异频率。到 解决这个问题，研究人员可以在样本期间附加随机条形码序列 准备。在排序时，条形码充当跟踪集合的签名 PCR扩增的分子回到原来的生物分子 从而区分原始分子中的稀有变体 下游引入的错误。

connor接受一个条形码的成对对齐文件（bam），对这些输入进行分组 对齐到族中，将每个族组合到一致对齐中，以及 发出一组重复数据消除一致性对齐（BAM）。

< Buff行情>

连接工作流：

排序[FastQ 1/2]->；对齐器[BAM]->；连接器[BAM]->；变异检测[VCF]

Connor First根据原始路线的 对齐位置和通用分子标签（umt）条形码。（康纳假设 传入的对齐序列以umt条形码开始。）每个系列 然后将对齐合并为单个一致对齐；差异 在基本要求和素质是由多数票通过家庭成员。 默认情况下，排除较小的族（<；3对对齐对）。

有关详细信息，请参见：

• 快速启动 ：开始消除条形码BAM的重复数据。
• 安装 ：其他安装方式。
• 方法 ：有关UMT条码结构的详细信息，建议 对齐参数、族分组的详细信息和示例。