从亚基因组样本中删除16srrna读取的简单说明
chfilter的Python项目详细描述
##叶绿体去除工具
这是一个简单的工具，可以从成对的末端样本中去除所有类似16srrna的读数。通过使用bowtie2，根据greengenes数据库中的16srrna筛选成对的末端读取，并从样本中删除。
--Biopython-->；
安装
<；！--python setup.py安装-->；
<；！--PIP安装。--升级-->；
-帮助显示此帮助消息并退出BIRED-1 PaReRe1 1 - BR/> - PAIRID-2 PaIrdI2成对读2 BR/>输出-BR/>< BR> >使用实例：BR/> CelDerect -PaReD1.//Test/R1.FQ-PAIRDE2-2./Test/R2.FQ-DUR./Test/BR/> BR/>输出文件
文件过滤后的叶绿体读数存储为
*.no-chl.fastq
这是一个简单的工具，可以从成对的末端样本中去除所有类似16srrna的读数。通过使用bowtie2，根据greengenes数据库中的16srrna筛选成对的末端读取，并从样本中删除。
--Biopython-->；
安装
<；！--python setup.py安装-->；
<；！--PIP安装。--升级-->；
-帮助显示此帮助消息并退出BIRED-1 PaReRe1 1 - BR/> - PAIRID-2 PaIrdI2成对读2 BR/>输出-BR/>< BR> >使用实例：BR/> CelDerect -PaReD1.//Test/R1.FQ-PAIRDE2-2./Test/R2.FQ-DUR./Test/BR/> BR/>输出文件
文件过滤后的叶绿体读数存储为
*.no-chl.fastq
欢迎加入QQ群-->： 979659372
