化学基因组富集分析
CGEA的Python项目详细描述
要使用cgea，请执行以下操作：
install:pip install cgea
cgea提供两个主要类：
druglistcgea（druglist，saveas=“json”，sort='up'，outputdir=none，prefix='cgearesults'，
data={}，numworkers=cpu count（），verbose=false，numpermutations=1000）：
genelistcgea（upgenes，downgenes，saveas=“json”，sort='up'，outputdir=无，前缀='cgearesults'，
数据={}，numworkers=cpu_count（），verbose=false，numpermutations=1000）：
参数：
up genes=基因集中上调基因的列表。
downgenes=基因集中下调基因的列表。如果不区分上下调节，则输入“无”。
druglist=查询集中的药物列表。
outputdir:如果要让函数为您保存输出，在此处提供输出目录。
前缀：如果定义了outputdir，则所有文件输出都将此作为前缀
async：如果希望程序异步运行，则将此设置为true
numpermutations：增加此数字将以牺牲速度为代价提高精度
verbose：将此设置为true以使程序给出状态更新其进度
numworkers:要使用多少内核
数据：您可以更改程序使用的数据。仅限高级用户。
方法：
运行-运行进程
对象：
结果-保存结果数据
示例操作：
myupgenes=[1,2,3]
mydowgenes=[4,5,6]
mycgea=genelistcgea（myupgenes，mydowgenes）
mycgea.run（）
结果=mycgea.results
install:pip install cgea
cgea提供两个主要类：
druglistcgea（druglist，saveas=“json”，sort='up'，outputdir=none，prefix='cgearesults'，
data={}，numworkers=cpu count（），verbose=false，numpermutations=1000）：
genelistcgea（upgenes，downgenes，saveas=“json”，sort='up'，outputdir=无，前缀='cgearesults'，
数据={}，numworkers=cpu_count（），verbose=false，numpermutations=1000）：
参数：
up genes=基因集中上调基因的列表。
downgenes=基因集中下调基因的列表。如果不区分上下调节，则输入“无”。
druglist=查询集中的药物列表。
outputdir:如果要让函数为您保存输出，在此处提供输出目录。
前缀：如果定义了outputdir，则所有文件输出都将此作为前缀
async：如果希望程序异步运行，则将此设置为true
numpermutations：增加此数字将以牺牲速度为代价提高精度
verbose：将此设置为true以使程序给出状态更新其进度
numworkers:要使用多少内核
数据：您可以更改程序使用的数据。仅限高级用户。
方法：
运行-运行进程
对象：
结果-保存结果数据
示例操作：
myupgenes=[1,2,3]
mydowgenes=[4,5,6]
mycgea=genelistcgea（myupgenes，mydowgenes）
mycgea.run（）
结果=mycgea.results
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