把药房换成贝尔的包裹
bio2bel-drugbank的Python项目详细描述
将DrugBank 5.0转换为BEL。
安装
bio2bel_drugbank可以通过PyPI轻松安装 您最喜爱的终端中的以下代码:
$ python3 -m pip install bio2bel_drugbank
或者来自GitHub上的最新代码,使用:
$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/drugbank.git@master
设置
警告
Drugbank需要一些下载和文件组织。很快就会被记录下来。
Python复制
>>>importbio2bel_drugbank>>>drugbank_manager=bio2bel_drugbank.Manager()>>>drugbank_manager.populate()
命令行实用程序
bio2bel_drugbank populate
引文
- Wishart,D.S.,等人。(2018年)。DrugBank 5.0: a major update to the DrugBank database for 2018。核酸研究,46(D1),D1074–D1082。