用户友好的综合转录组分析应用
AltAnalyze的Python项目详细描述
Altanalyze是一个非常友好的开源工具包，可用于广泛的基因组学分析。这些分析包括直接处理原始rnaseq或微阵列数据文件、利用icgs发现单细胞群体的先进方法、差异表达分析、选择性剪接/启动子/聚腺苷酸化分析和先进的异型功能预测分析（蛋白质、结构域和microrna靶向）。Altanalyze支持多种高级可视化工具和点菜分析方法（如网络、路径、拼接图）。altanalyze与rnaseq数据（fastq、bam、bed）、微阵列平台（基因1.0、外显子1.0、连接和3'阵列）的各种数据输入兼容。此软件不需要生物信息学程序、脚本或高级计算机硬件的高级知识。用户友好的videos、online tutorials和blog posts也可用。
altanalyze文档可以在Read The Docs上找到，独立的档案可以在sourceforge和GitHub上找到。
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