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Python rnaseq
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最新问答
Possible Duplicate:
Help with Python UnboundLocalError: local variable referenced before assig ...
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我有一个.json文件,有448条记录。文件的格式如下-
2条记录作为样本数据
{
"_id" : ObjectId("5a5faa4f8b91277fde0212b1"),
"geo ...
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下面是我在bash中的工作代码:
inputDir='bla/bla/RNAseq/fastq/original/test'
for trimFile in $inputDir/*".1.trimm ...
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我以前使用类似的代码创建了一个docker容器,如下所示,但我运行了一个基本的python脚本来打印“Hello”。我试图在R中执行RNASeq,并且在尝试运行代码时不断遇到问题
这是我的Docker ...
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我有一个用Snakemake编写的分析生物测序数据的工作流程。工作流期望所有的数据文件都被组织起来,以便每个原始读取文件都以分析类型(RNASeq、dnaseq等)开始,并且在工作流生成的所有文件中都 ...
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我对aws和s3还很陌生,所以如果这看起来像是我没有尝试过什么,请原谅。我想遍历目录和文件,读取文件并从可公开访问的s3存储桶中检索特定的行:s3://cgl-rnaseq-recompute-fix ...
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我正试图将一份研究摘要表过滤成与“RNA测序”主题更相关的内容
SELECT * FROM RNAseq
WHERE
MATCH (abstract_text) AGAINST ('"use ...
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我有一个大约20000的文件夹焦油.gz目录,每个目录包含一堆文件。我想进入源文件夹,遍历焦油.gz目录(不解压缩)并连接文件,这样在最后我将有三个大文件。你知道吗
例如,我有一个根文件夹pnoc,其 ...
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最新项目
OMics Pipe是一个开放源代码的模块化计算平台,它自动化了自然协议和其他常用管道(如GATK)中发布的“最佳实践”多OMics数据分析管道。目前,它为两条rnaseq和mirnaseq管道、全外 ...
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Altanalyze是一个非常友好的开源工具包,可用于广泛的基因组学分析。这些分析包括直接处理原始rnaseq或微阵列数据文件、利用icgs发现单细胞群体的先进方法、差异表达分析、选择性剪接/启动子/ ...
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grape 2.0为rnaseq提供了广泛的管道
易观。 ...
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展开==…图片::https://travis ci.org/yjzhang/uncrl_python.svg:目标:https://travis ci.org/yjzhang/uncrl_pytho ...
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这是什么?
一个开源的python库,使rnaseq文件的预处理更加方便
Circleci生成状态:
travisci生成状态:
有关Read the Docs的完整文档
版权和许可
有关完整的 ...
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此包的作者未提供项目说明 ...
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Wur线虫学RNASEQ管道
此包Python名称:rnaseqpipeline
目前版本: rnaseqpipeline 0.1
...
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加州大学圣克鲁斯分校计算基因组实验室基于toil的rna序列工作流程
此包Python名称:toil-rnaseq
目前版本: toil-rnase ...
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rnaseq-plotter
此包Python名称:rnaseq-plotter
目前版本: rnaseq-plotter 0.1
...
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与当前研究相关的便利功能库
此包Python名称:rnaseq-lib3
目前版本: rnaseq-lib3 1.0a1
最后维护时 ...
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