磁铁碎片计算
aimdfragmentation的Python项目详细描述
自动碎片aimd计算
从头计算分子动力学（aimd）的自动破碎化方法。
作者：曾金哲
要求
安装
使用pip
$ pip install aimdfragmentation
从源构建
您应该先安装Gaussian 16和OpenBabel。然后：
git clone https://github.com/njzjz/aimdfragmentation
cd aimdfragmentation/
pip install .
示例
运行python程序
您可以以examples/example.py为例，并使用以下命令运行：
python example.py
与lammps一起运行md
请参阅njzjz/Pyforce存储库并安装pyforce模块。然后将examples/example.py重命名为force.py，并将其放在运行lammp的地方。在lammps输入文件中添加一行：
fix 1 all pyforce C H O
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