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Python peptide
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关于peptide 相关联的Python项目和问题：
最新问答
在文件2的第2列（包含许多由";"分隔的值的PDBid）中从文件1搜索第2列的值。如果找到，则合并文件1和文件2的所有列
文件1：
peptide,PDB_ID
pep1,4BAK
pep1,4BA ...
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这是我的密码。如果我打印变量，效果很好，但是如果我返回变量并尝试在其他地方打印它们，则只打印最后一个元素。你知道吗
def train_data(fname):
#load csv trai ...
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我有一组代谢物在一个系统的各个部分中存在的数据。我也有关于每种代谢物是什么类型的信息。我想要一个频率表，显示每种类型的代谢物在每个隔间的数量。数据如下：
df = pd.DataFrame({'met ...
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我有一个“短字符串”列表，例如：
['mkwvtfillfssaysrgv'，'SSAYSRGVFRRDTHKSEIAH'，'KPKATEEQLKTVMENFVAFVDKCCA']
我需要匹配word ...
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我正在对人类蛋白质组进行电子消化，这意味着我试图在某个位置切割每个蛋白质的氨基酸序列。我正在我创建的一个更大的函数中使用Pyteomics解析器函数Pyteomics Parser
我得到这个错误：
...
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我正在使用matplotlib绘制条形图，当我试图访问标签（在X和Y轴上）以更改它们时，遇到了一个问题。特别是，本规范：
fig = plot.figure(figsize=(16,12), dpi= ...
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我试图使用tkinter中的文本小部件来显示代码的输出
sequence = ("This peptide contains ", len(Peptide), "total residues", "\ ...
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我想做的事
我对Python有点陌生，使用panda库的经验有限。但是，我一直在尝试修改以下数据框，以便程序获取contents 3 CSV文件，基于第一个和第二个数据框中的数据创建两个新变量，然后将 ...
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当一个csv文件被一个新的.m文件切割后，我将不允许用一个新的csv.m来写一个新的.m文件，然后用一个csv文件来切割它们。这很有魅力，但是。。。在
然后我需要把这些字符串中的每个字符串都提取出来， ...
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我想弄明白为什么第二个字符串“peptide\ u seq”绕过了第一个if语句？这三个字符串应该遍历if语句并返回以下语句：
Convert the string to uppercase.
...
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我想做的是估计每个肽的得分，即行
我的代码如下：
import csv, math
def train_data(fname):
#load csv training files
...
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我的问题是：我有一个代表一个环状肽的序列，我试图创建一个能产生所有可能的亚肽的功能。当两个氨基酸之间的键被破坏时，就会产生一个亚肽。例如：对于肽“ABCD”，它的子肽是“A”、“B”、“C”、“D”、 ...
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最新项目
Pyrepr
为人类打印可序列化的对象。这是基于Markdownify和TOML。
用法
from pyrepr import Repr
print(Repr(obj))
示例输出：
[[mid]] ...
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氨基酸k-mer工具，用于创建、搜索和分析来自基因组或dna读取的系统发育特征。
先决条件
需要64位Python3.4或更高版本。建议使用8 GB或更大的内存。
aakbar的python依赖项是 ...
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基于肽串的快速dbscan聚类
此包Python名称：fast_dbscan
目前版本： fast_dbscan 0.1.1
最后维 ...
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