将字符串的第一个单词改为第一个我想把字符串的第一个字改成那个字的第一个字母。对于生物体,你可以写“拟南芥”或“拟南芥”。 因为字符串名称有时对我来说太长了,所以我想更改它,使字符串变短。你知道吗 我试图找到一个类似的问题,但它总是 ...2024-04-29 已阅读: n次
下载多种生物的蛋白质序列我正在尝试使用biopython下载由特定机构测序的生物体的所有蛋白质。我有每种生物的生物名称和生物项目;特别是我想分析一些最近的基因组序列中发现的蛋白质。我想用最友好的方式下载蛋白质文件。我最近尝试 ...2024-04-29 已阅读: n次
李氏百科全书中的生活史资料我是一个有一些编码经验的环境科学家。你知道吗 这是我第一次尝试在文本刮。你知道吗 我正试图从《生命百科全书》的traitbank数据库中提取某些生命史数据。你知道吗 例如,如果我想收集每个生物体的“寿 ...2024-04-29 已阅读: n次
迭代BLAST寻找同源基因我是编程新手,在过去的几周里,我一直在研究一个生物信息学问题,进展非常有限。在 用一个大的同源基因序列来识别所有的同源基因(“1”=存在,“0”=不存在。有人告诉我,一个交互式的all vs all ...2024-04-29 已阅读: n次
比较两个文件并显示一个矩阵,其中0和1表示不存在或存在我是python新手,所以我真的很难编写脚本 所以,我需要的是对两个文件进行比较。一个文件包含某个数据库中的所有蛋白质,另一个文件只包含另一个文件中的部分蛋白质,因为它属于一种生物体。所以我需要知道这 ...2024-04-29 已阅读: n次
在列表中搜索重复项使用matplotlib来模拟生物体生命周期的基本项目。有机体的位置由列表[x,y]定义,其位置是随机生成的。生物是类 for i in range(numorganisms): ...2024-04-29 已阅读: n次
从多个fasta文件中创建生物体和DNA序列数据列表我正在处理fasta格式的DNA序列数据,需要创建两个包含生物体名称和序列的列表。我遇到了下面的帖子Add multiple sequences from a FASTA file to a list ...2024-04-29 已阅读: n次
如何为我的遗传算法创造环境?我正在用python编写一个遗传算法,关于一个虚拟生物体的最佳移动序列,它将获得2D网格中最随机放置的食物。它没有智慧,它只是以圆形或正方形的模式运动。我为生物体所在的环境创建二维数组的代码是: gr ...2024-04-29 已阅读: n次
Python“NoneType”对象查询我是个Python怪。为了学习我正在制作一个自然选择模拟器,但我有点卡住了。在 一点背景知识: 我列出了一个随机位模式的有机体,如下所示: population.append(chromosone.C ...2024-04-29 已阅读: n次
使用登录号从ENA数据库的ftp服务器下载数据我想下载ENA数据库中给出的一些生物体的完整蛋白质序列(在ENA部分的基因组下),以及我所掌握的信息,即大约2500个登录号。在 我试着用分类法在ftp服务器上更深入地查找它们。但找不到任何相关的东西 ...2024-04-29 已阅读: n次
FEV-KEGG自述文件==fev\@kegg----fev\@kegg允许轻松分析kegg(京都基因和基因组百科全书)中生物体的代谢网络。请阅读以下api文档:https://fev kegg.readthedoc ...2024-04-29 已阅读: n次
recentrifuge亚基因组学的稳健比较分析和污染去除 使用recentrifuge,研究人员可以交互地探索样本中的生物体以及在何种置信水平下,从而能够在任何亚基因组研究中对多个样本进行稳健的比较分析。 使用一种新的 ...2024-04-29 已阅读: n次