亚基因组学的稳健比较分析与污染去除

recentrifuge的Python项目详细描述


亚基因组学的稳健比较分析和污染去除

Build Status

使用recentrifuge,研究人员可以交互地探索样本中的生物体以及在何种置信水平下,从而能够在任何亚基因组研究中对多个样本进行稳健的比较分析。

  • 使用一种新的robust污染物去除算法去除各种污染物,包括交叉点。
  • 为每个结果提供置信水平,因为计算的分数会传播到所有下游分析和比较。
  • 通过一个新的比较分析引擎,揭示了亚基因组样本的普遍性和特异性。

recentrifuge的新方法结合了稳健的统计、评分分类树算法和并行计算算法。

在亚基因组研究中,以及在临床、环境和法医分析等需要对少数生物进行更可靠的检测时,recentrifuge尤其有用。在recentrifuge中提供的不同置信水平中,它实现了一些非常有用的可变长度读取,例如由纳米孔序列器生成的读取。


要播放由recentrifuge生成的网页示例,请单击屏幕截图:

Recentrifuge test screenshot

Recentrifuge webpage example

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
java OpenJDK交叉编译:失败无法生成目标   java使用Hibernate向postgresql表插入json值   Java7中的新Swing JLayer   java从另一个类访问方法和属性,而不实例化它   java右键单击弹出菜单无法聚焦JTextField   java是否可以使用jpa@Query调用Oracle函数   java是打印任何类型的ArrayList元素的通用方法   使用多重映射作为参数的Java   java我有两个字符串,内容相同,但哈希代码不同,因此。equals方法正在重新运行false。请建议如何解决这个问题   java JPA查询元素集合   java如何将数据从请求绑定到现有对象?多步骤形式   java在没有警告的情况下转换泛型类型?   声明Java乘法长和浮点数,结果是哪种数据类型?