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Python chembl
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关于chembl 相关联的Python项目和问题：
最新问答
我试图从chembl数据库中搜索一种酶。为此，我用GoogleColab编写了这个命令行
! pip install chembl_webresource_client
这表明flask和其他软件包 ...
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需要您的帮助，我尝试在colab上安装chembl_webresource_客户端，它通常工作正常，但今天让我惊讶的是，在第一步就出现了错误
!！pip安装chembl_webresource_客户端 ...
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根据docs我可以每分钟调用代码搜索API 5次，而无需任何凭据。
所以我应该能够使用python请求：
import requests
user_agent = {'User-Agent': 'Aw ...
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因此，我一直在查看文档，但找不到任何相关内容。在SDF文件中，Chembl name为空，但我确实有我想要的Chembl ID条目。这是
15 12 2 0
16 13 1 0
17 1 ...
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我有一个名为test1.py的简单脚本
#!/usr/bin/env python
from argparse import ArgumentParser
def cmdlineparse(): ...
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在我的代码中（https://github.com/chembl/chembl_webresource_client/blob/master/chembl_webresource_client/web ...
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我已经安装了chembl_webresource_客户端软件包
然后我尝试从包中导入一个模块：
from chembl_webresource_client.new_client import new ...
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我试图搜索一个大型化学数据库（chembl，>；1000000个条目），但在我的工作计算机上执行代码时遇到问题。我们的重点是化学品，所以没有高质量的计算机。在
下面是我的代码，对于较小的条目（大 ...
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我是一个快乐的人，有他自己的快乐本地pip指数。有一天我更新了pip客户端，我不高兴了：
Downloading/unpacking super_package
Getting page https: ...
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在我的web应用程序中，我有以下代码：
from rdkit import Chem
这导致它在apache下崩溃，在日志中我可以看到：
^{pr2}$
看起来这个问题是由LD_LIBRARY_PA ...
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有类似的问题，但是，我发现这些特定的职位有点难以遵循
我有以下类型的查询集：
chembl_webresource_client.query_set.QuerySet
打印QuerySet对象时，我 ...
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我已经成功地使用官方补丁在pypy上安装了cx_Oracle。在
现在，每次django尝试执行任何sql时，我都会得到：
MyTable.objects.using("ora").count()
...
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最新项目
化学品附加费图片：：https://img.shields.io/pypi/v/chembl_extras.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/chembl_ext ...
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化学烧杯图片：：https://img.shields.io/pypi/v/chembl_beaker.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/chembl_beake ...
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商业模式图片：：https://img.shields.io/pypi/v/chembl_business_model.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/chem ...
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化学迁移模型图片：：https://img.shields.io/pypi/v/chembl_migration_model.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/c ...
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化学核心模型图片：：https://img.shields.io/pypi/v/chembl_core_model.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/chembl ...
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pychembldb是chembldb的python接口
要求
Python2.7或更高版本（不支持3.x）
mysql python>；=1.2.4或psycopg2>；=2.5.1 ...
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化学迁移图片：：https://img.shields.io/pypi/v/chembl_migrate.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/chembl_migr ...
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化学核心数据库图片：：https://img.shields.io/pypi/v/chembl_core_db.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/chembl_c ...
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Chembiohub化学数据库中化合物的唯一标识符生成器
文档
完整的文档位于https://cbh_chembl_id_generator.readthedocs.org。
快速启动
安 ...
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chembl_compatibility这是在英国剑桥embl-ebi的chembl group开发的chembl_compatibility包。这个包在迁移和核心模型以及迁移创建的数据库之间提供了一 ...
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文档和存储库：https://github.com/chembl/chembl_webresource_client。
这是chembl（https://www.ebi.ac.uk/chembl/） ...
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chembl web服务的扩展，允许为写操作、权限和协作添加其他功能
文件
完整的文档位于https://cbh_chembl_ws_extension.readthedocs.org。
...
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###克里比是什么？
clippy是一个简单的桌面应用程序，它使用不同的格式作为输入来呈现化学结构。
关键是应用程序直接从你的剪贴板（因此命名为clippy）而不是文件中读取输入。
一旦有了渲染结构， ...
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Chembl_分析网络图片：：https://dl.dropboxusercontent.com/u/10967207/static/assay_net.png：alt:screenshot ...
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chembl_web services版本2.x==[实时文档]（https://www.ebi.ac.uk/chembl/api/data/docs）[API规范]（https://www.ebi. ...
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