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关于tsv 相关联的Python项目和问题：

Python大型.tsv文件到.csv fi

实际上，下面的代码可以成功地将.tsv文件转换为.csv文件，但是，当文件很大时（比如超过1GB），它在read函数中有一个MemoryError。在 import re tsv = open('ts ...

2024-04-27 已阅读: n次

如何将.tsv转换为.csv？

正在尝试将.tsv转换为.csv。这： import csv # read tab-delimited file with open('DataS1_interactome.tsv','rb') a ...

2024-04-27 已阅读: n次

在Python中将数组转换为CSV/tsv格式的字符串

Python提供了csv.DictWriter，用于将CSV输出到文件。将CSV输出到字符串或stdout的最简单方法是什么？在例如，给定这样的二维数组： [["a b c", "1,2,3"], ...

2024-04-27 已阅读: n次

d3不在pythonFlask脚本中加载tsv数据

python中的新特性，正在研究图形解决方案。面临的问题是，d3如何加载tsv数据。在已在链接-https://bl.ocks.org/mbostock/3884955上获得所需的解决方案。我下载了 ...

2024-04-27 已阅读: n次

索引器错误：列表索引超出范围CSV par

我试图使用此代码分析csv文件，但无法找到解决此错误的方法： “File”（文件位置），第438行，在解析器42中位置=tmp2[1] 索引器错误：列表索引超出范围“ 我的csv文件结构如下：突变 ...

2024-04-27 已阅读: n次

加快数据提取

我在SQL数据库中有超过一百万行的数据。我想把整个数据写入TSV文件。我使用下面的代码来获取前100000行。提取并写入TSV文件需要将近20分钟。有没有其他方法来加快这一进程 cursor.exe ...

2024-04-27 已阅读: n次

如何在spark scala（非pyspark）中使用melt函数

我想读取一个tsv文件并转换为特定的模式，然后将结果转换为tsv。我尝试使用pandas在python中编写代码。但是我不能运行它，因为它需要很多内存我想在spark scala做同样的事情。但s ...

2024-04-27 已阅读: n次

__name_uuuuu=“\uuuu main_uuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuu？

很高兴认识你，让我先给你看一个简化的代码 from multiprocessing import Pool AAA = [] def input_list(): with open('./ ...

2024-04-27 已阅读: n次

如何保存类似python的ts的输出

我正在使用biopython包，我想把结果保存为tsv文件。从打印输出到tsv。 for record in SeqIO.parse("/home/fil/Desktop/420_2_03_074.f ...

2024-04-27 已阅读: n次

如何从带有Pandas的数据帧中删除列？

我读了我的资料 import pandas as pd df = pd.read_csv('/path/file.tsv', header=0, delimiter='\t') print df 得 ...

2024-04-27 已阅读: n次

CSV未在Windows上读取Python上的所有行

我正在尝试将TSV文件的所有行读取到列表中。但是，TSV读取器提前终止，而不是读取整个文件。我知道这一点，因为data仅为整个文件长度的1/6。发生这种情况时不会抛出错误当我手动检查它终止的行（对应 ...

2024-04-27 已阅读: n次

Pandas读取csv期间标记数据时出错。怎样才能真正看到不好的线条？

我有一个大的csv，加载如下 df=pd.read_csv('my_data.tsv',sep='\t',header=0, skiprows=[1,2,3]) 在装载过程中我发现了几个错误。首 ...

2024-04-27 已阅读: n次

FindSim

findsim 神经元数据和信号模型集成框架。相关文件可用在https://doi.org/10.3389/fninf.2018.00038 关于 findsim项目将神经和细胞信号的模型映射到 ...

2024-04-27 已阅读: n次

pyexcel-cli

而对于一个还没到目前为止还还没有一个够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够够 ...

2024-04-27 已阅读: n次

detect-delimiter

检测分隔符关于检测CSV、TSV和其他特殊文件格式中使用的分隔符。安装使用pip install detect_delimiter 用法 detect_delimiter公开了detect() ...

2024-04-27 已阅读: n次

openregister-entr

以多种不同的表示形式（包括tsv、csv和规范json）管理寄存器条目数据。 ...

2024-04-27 已阅读: n次

expressionable-cli

#expressionable cli是[expressionable]python模块（https://github.com/srp33/expressionable）的官方命令行界面。从命令行可以 ...

2024-04-27 已阅读: n次

dicttokv

dicttokv将嵌套字典和列表对象转换为键值元组。元组对于键值存储和机器学习非常有用。要求 Python2.7或更高版本（不支持3.x）功能包括TSV转换方法。设置 $ ...

2024-04-27 已阅读: n次

elasticsearch-loader

主要功能批量上传csv（实际上是任何*sv）文件到elasticsearch 批量上传json文件/json行到elasticsearch 批量上传拼花文件到ElasticSearch 预定义自 ...

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pycounter

pycounter使使用COUNTER python中的使用统计信息很容易，包括使用niso获取统计信息 SUSHI。从sushi服务器获取jr1报告的简单命令行客户机并将其输出为制表 ...

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tsv

tab-分隔-值IO库此包Python名称：tsv 目前版本： tsv 1.2 最后维护时间：Oct 27, 2016 ...

2024-04-27 已阅读: n次

expressionable

#expressionable python模块expressionable python模块的官方存储库，它允许：*将表格数据集从一种格式转换为另一种格式。*查询大数据集以筛选有用的数据。*选择要包 ...

2024-04-27 已阅读: n次

shapeshifter

#shapeshifter python模块shapeshifter python模块的官方存储库，它允许：*将表格数据集从一种格式转换为另一种格式。*查询大数据集以筛选有用的数据。*选择要包含在结果 ...

2024-04-27 已阅读: n次

pySWEETCat

从SWEET-Cat下载数据的纯python包。这个小软件包是作为python课程中的一个练习开发的（参见CONTRIBUTORS）。它从sweet cat的恒星参数在线目录下载所有数据并为每一 ...

2024-04-27 已阅读: n次

mtbparser

关于本模块这个python模块的设计目的是为不同的诊断变量信息数据提供一个简单的解析器。如何使用snvparser类按照上述格式解析snv文件相当简单。只需创建一个带有tsv文件路径的Sn ...

2024-04-27 已阅读: n次

spada

SPADA spada（灵活发现的剪接导致的蛋白质改变）是研究病例对照研究中选择性剪接改变的功能影响的工具。这些变化被表示为同型开关，即情况下最好由一个同型表示，而控制最好由另一个不同的同型表示 ...

2024-04-27 已阅读: n次

tspex

tspex Overview Documentation Installation Python API tutorial Command-line interface Examples 概述 t ...

2024-04-27 已阅读: n次

swimmers-plot

#游泳者阴谋为一个队列创建一个游泳运动员的治疗图要安装： pip安装游泳者图使用： ` import swimmers_plot cohort = swimmers_plot.Cohort() ...

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pyclpa

这是一个试图创建跨语言语音字母表的尝试，实现为伊帕方言一种伊帕方言，可用于语言的跨语言方法比较。基本思想是提供一套固定的符号来表示语音。以及关于他们发音的完整描述 IPA的传统。当新的语言它 ...

2024-04-27 已阅读: n次

cross

如果您处理文本fomat（tsv/csv）中的每一个数据，cross将帮助您不编写您重写了数千次的脚本，以跨越共享同一键列的两个文件。 ...

2024-04-27 已阅读: n次

sciencebeam-utils

科学束实用程序提供与ScienceBeam项目相关的实用程序函数。请参考development documentation 如果你想为这个项目做贡献。大多数工具还没有记录在案。请随意浏览代码或 ...

2024-04-27 已阅读: n次

olga

##概要olga（免疫球蛋白氨基酸序列的优化似然估计）是一个python 2.7软件，用于从v（d）j重组的生成模型计算氨基酸和帧内核苷酸cdr3序列的生成概率。最近在适应性免疫系统中普遍存在的序列排 ...

2024-04-27 已阅读: n次