我在功能强大的服务器上使用ete2模块已经有一段时间了。
一切都很好,直到它开始运行非常缓慢(每分钟一个get_taxid_translator()
函数),现在我甚至无法通过ncbi = NCBITaxa()
赋值。
我已经卸载并重新安装了anaconda2,尝试更新到ete3,在我们的“开发服务器”上一切正常,但在我们的普通服务器上仍然无法通过任何软件的ncbi = NCBITaxa()
行。即使下面的脚本也无法完成
#!/usr/bin/env python
from ete3 import NCBITaxa
ncbi = NCBITaxa()
print "Finished"
这发生在其他人身上了吗?我需要降级任何依赖项吗?可能是权限问题吗?
当我运行基本脚本时,ctrl+c或ctrl+z将转义脚本,我必须使用kill -9 <job-id>
终止脚本。如果我等待的时间太长,进程将进入不间断睡眠。你知道吗
先谢谢你, 亚历克西斯。你知道吗
Python 2.7.12::Anaconda自定义(64位) 通用条款(gcc)5.4.0
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