使用GDAL将数据写入GeoTiff而不创建数据数组?

2024-05-23 22:10:50 发布

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是否可以使用gdal的write array逐行编写数据,而不是创建和提供整个数组?

创建大小为(5053998357)的numpy数组时遇到了MemoryError。我想我可以绕过这件事,但我不想把事情复杂化

>>> import numpy
>>> cols = 50539
>>> rows = 98357
>>> a1 = np.zeros((cols,rows))
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
NameError: name 'np' is not defined
>>> import numpy as np
>>> a1 = np.zeros((cols,rows))
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
MemoryError

更新: 最后,我使用Abudis的解决方案和一个稀疏矩阵相结合,在这个矩阵中我保存了点,将每一行作为一个“密集”或标准矩阵取出。欢迎评论。

dataset = driver.Create(filename, cols, rows, number_of_bands, band_type)
band = dataset.GetRasterBand(1)
offset = 1 # i.e. the number of rows to write with each iteration

# values, pixel_x, and pixel_y defined earlier in my script
data = scipy.sparse.csr_matrix((values,(pixel_y,pixel_x)),dtype=float)

# iterate data writing for each row in data sparse array
for i in range(data.shape[0]):
    data_row = data[i,:].todense() # output row of sparse array as standard array
    band.WriteArray(data_row,0,offset*i)
band.SetNoDataValue(NULL_VALUE)
band.FlushCache()

Tags: ofinnumpydatabandnp矩阵数组
1条回答
网友
1楼 · 发布于 2024-05-23 22:10:50

这里并不是真正的专家,但看起来这很管用。所以,诀窍是使用WriteArray方法的yoff参数。这样就可以将数据分块写入文件。我们基本上只是在写入下一块数据时设置偏移量。

import numpy as np
import gdal

cols = 50539
rows = 10000
offset = 1000

dst_filename = 'test.tif'
format = 'GTiff'
driver = gdal.GetDriverByName(format)

dst_ds = driver.Create(dst_filename, cols, rows, 1, gdal.GDT_Byte)

for i in range(10):
    # generate random integers from 1 to 10
    a = np.random.random_integers(1, 10, size=(offset, cols))
    # write data to band 1
    dst_ds.GetRasterBand(1).WriteArray(a, 0, offset * i)

dst_ds = None

这将生成50539x1000像素的tiff文件。如果您真的需要98357行,我想您可以将offset值设置为1,将rows设置为98357。理论上它应该可以工作,因为它工作在更小的阵列上(10×20像素)。

编辑:不要忘记将range(10)更改为range(98357)xrange(98357)

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