AttributeError:“numpy.ndarray”对象没有“split”属性

Question

我想回答下列问题 “一位同事制作了一份文件，每行有一个DNA序列。下载文件并使用numpy.loadtxt（）将其加载到Python中。您需要使用可选参数dtype=str来告诉loadtxt（）数据是由字符串组成的。

计算每个序列的GC含量。GC含量是G或C碱基的百分比（占总碱基对的百分比）。将每个序列的结果打印为“序列的GC含量为XX.XX%”，其中XX.XX是实际GC含量。使用“格式化字符串”执行此操作

导入dna序列文件并将它们连接在一起后，我现在想将字符串拆分为5个序列（对应于5行中的每一行），然后开始计算。。。

注意：这是文件源：http://www.programmingforbiologists.org/data/dna_sequences_1.txt

这是我的代码：

import numpy
dna_data=numpy.loadtxt("dna_sequences",dtype=str)
",".join(dna_data)
seq1,seq2,seq3,seq4,seq5=dna_data.split(",",4)

我收到以下错误消息： AttributeError:“numpy.ndarray”对象没有“split”属性

请帮忙！！！

Answer 1

正如注释中所说：",".join(dna_data)不修改dna_data，它只返回一个字符串，您必须将其存储在其他变量中。像这样：

s = ",".join(dna_data)
seq1,seq2,seq3,seq4,seq5=s.split(",",4)

更进一步：

（注意，您似乎对numpy还不熟悉：在下面的示例中，我假设dna_data有一个形状(5,)如果不是这样，您可以使用very basic slicing返回到该形状）

也就是说，使用该代码，您只需将数组转换为一个列表，然后放入5个不同的变量，因此，当您可以只在一行seq1,seq2,seq3,seq4,seq5 = dna_data中放入数组->；string->；list->；变量时，非常多。

我会更进一步：不要这样做！当您只需要使用dna_data[n]而不是任何seq*变量时，拥有多个变量有什么意义？前者更方便，并且允许无痛苦地做一些事情，比如用for循环遍历所有序列。例如：

for seq in dna_data: 
    print(seq)