我有一个空间隔离的文件,我必须从中获取特定列的数据。我的文件如下所示:
chr1.trna124 (75052562-75052633) Length: 72 bp
Type: His Anticodon: ATG at 33-35 (75052594-75052596) Score: 35.2
HMM Sc=29.40 Sec struct Sc=5.80
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: TGGGGTATAGCTCCATGGTAGAGCGCATGCCTATGAAGCGTGAGGtCCTGGGTTTGATCCCCAGAACCACAA
Str: >>>>>>>..>>>>.......<<<<.>>>>>.......<<<<<.....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
chr1.trna131 (78297795-78297866) Length: 72 bp
Type: Pro Anticodon: AGG at 33-35 (78297827-78297829) Score: 39.1
HMM Sc=24.30 Sec struct Sc=14.80
* | * | * | * | * | * | * |
Seq: GGCTTGTTGGTCTAGGGGTATGATTCTCACTTAGGGTGTGAGAGGtCCTGGGTTCAAATCTTGGACGAGTCC
Str: >>>>>>>..>>>>.......<<<<.>>>>>.......<<<<<.....>>>>>.......<<<<<<<<<<<<.
从上面我想提取ID ie“chr1.trna124”列和Anticodon的第二行:ATG在33-35只有33-35直到文件结束。 最好的办法是什么? 我正在尝试将模式匹配“chr”的行合并到下一个“chr”,然后获取列。我试过通过How to grab the lines AFTER a matched line in python但是我甚至都做不到。有没有更好的办法? 在python2x和3X中有不同的方法吗
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