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wholecell-vivarium的Python项目详细描述
生活区
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Vivarium是一个动态模拟细胞的多尺度平台 它们能在其中生长、分裂和繁衍的环境。在
文档和教程
概念
动物饲养场是一个“生命之地”——在受控环境中饲养生物体以供观察或 研究。典型的水族馆包括水族馆。这个存储库中提供的vivarium是一个计算的 用于在动态环境中培养全细胞模型剂菌落的生活室。它的框架是 全单元建模、基于agent的建模、多尺度建模和模块化编程。在
Vivarium是一个框架，用于将不同细胞过程的混合模型组合成agent，并放置许多agent 在一个共享的空间环境中观察它们之间的相互作用。Vivarium的分布是因为这些代理可以在其中运行 不同的线程或在不同的计算机上，并在单元划分时分配新的线程。探员们交流 通过消息传递，并由接收所有消息的环境模拟进行协调， 集成它们，并用每个代理的新更新的本地环境响应它们。在
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