[ adamtaranto ] 共有 9 个PyPI Python项目:
derip2
通过校正多序列dna比对中的rip样突变来预测真菌重复序列的祖先序列。 项目维护者: adamtaranto |
blastbesties
从blast输出文件中快速发现对等的最佳blast对。 项目维护者: adamtaranto |
tirmite
将tir-phmm模型映射到基因组序列,以注释螨虫和完整的dna转座子。 项目维护者: adamtaranto |
frisk
frisk:使用多阶kmer检测序列组成异常。 项目维护者: kdmurray91 | adamtaranto |
yanagiba
过滤短的或低质量的牛津纳米孔读数,这些读数是以albacore为基础的。 项目维护者: adamtaranto |
teloclip
筛选包含未组装端粒重复序列的软剪裁比对的sam文件。 项目维护者: adamtaranto |
mimeo
扫描基因组中的内部重复序列,在另一个物种中重复的元素,或物种之间的高恒等hgt候选区域。 项目维护者: adamtaranto |
tinscan
寻找转座子插入位点特征的对齐特征。 项目维护者: adamtaranto |
TE-splitter
从逆转录转座子(ltrs)或dna转座子(tirs)中提取末端重复序列。从完整的DNA转座子合成合成螨。 项目维护者: adamtaranto |