将VCF文件拆分为可理解的制表符分隔文件
unvcf的Python项目详细描述
将VCF文件拆分为可理解的制表符分隔的文件。
vcf代表变量调用格式,广泛用于 生物信息学节省XX信息足够灵活 存储广泛的数据。尽管它的灵感来自csv文件 (我想)使VCF易于人类阅读和分析 现在的机器在这两种情况下都不太好用。它是一个 一种文件格式,其完整规范不能作为 VCF文件可以自由指定自己字段的格式。因此, 处理VCF文件中包含的数据的第一步通常是 提取一个子集并将提取的数据转换为 可修改的文件格式。
这个命令行python包旨在解决上述问题。它 将VCF格式拆分为标准CSV文件,每个文件 包含原始VCF文件的不同字段。因此 使人和机器更容易阅读。
安装
假设您安装了最新的python,那么 当然有安装联合国志愿人员方案的所有必要条件。从 终端,输入:
pip install unvcf
用法
安装后,您将有权访问unvcffrom 终点站。在这种情况下,您可以按如下方式开始使用它:
unvcf path_to_file.vcf destination_folder/
这将生成代表 path_to_file.vcf。有关详细信息,您可以输入
unvcf --help
如果您遇到任何问题或有任何改变,请创建 new issue我们会 试着尽快解决它。
许可证
这个项目是根据MIT License授权的。